东北地区手足口病病毒流行株EV71的分子生物学研究

发布时间：2017-10-06 18:25

  本文关键词：东北地区手足口病病毒流行株EV71的分子生物学研究

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【摘要】：手足口病是近年来多发于婴幼儿中的传染病,它由多种肠道病毒引起,多数患者症状比较轻微,也有少数患者病情进展迅速,甚至导致死亡。 我们利用Real-Time PCR的方法,将2010年8月至10月里在吉林大学第一医院传染病科室收集到的253例手足口病患者的咽N子样本进行检测,其中196例为肠道病毒阳性患者,感染EV71的患者约占肠道病毒感染总数的42.8%,其次为CA16感染,约占肠道病毒感染总数的28.6%。 我们将长春3株EV71病毒株与肠道病毒的其他类型进行全基因组的系统进化树分析,可以看出长春的EV71流行株与近几年我国大陆的流行株一样,均为C4亚型。我们用相同的参考株,对病毒的VP1区进行了系统进化树分析,得出的结果却与全基因组分析结果并不相同,这就暗示病毒中出现了基因重组的现象。 为了进一步验证病毒的基因重组,我们又对长春3株EV71病毒株与其他亚型的肠道病毒进行了相似性和重组分析,发现在P2和P3区确实存在着组间和组内的重组现象。5’UTR区的系统进化树更是与全基因组的系统进化树有着非常大的不同，，这说明病毒的基因重组与5’UTR区也有着密切的关系。 在253例样本中,我们有22.5%的手足口病患者没有检测出肠道病毒感染,结合5’UTR区的系统进化树分析,我们认为导致长春手足口病的病原体,除了最常见的EV71和CA16,还有其他没有确定的非主流病原体。而确定非EV71和CA16的肠道通用阳性病毒,对未来手足口病流行的预测、疫苗的研制和治疗都具有非常重要的意义。
【关键词】：HFMD EV71 系统进化树 基因重组
【学位授予单位】：吉林大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2013
【分类号】：R373.9
【目录】：

• 前言4-6
• 摘要6-7
• Abstract7-11
• 第1章 绪论11-20
• 1.1 手足口病的定义及 EV71 的研究概况11-15
• 1.1.1 手足口病的发病概况11-13
• 1.1.2 手足口病的临床特征及其鉴定诊断13-14
• 1.1.3 手足口病的预防及应对措施14-15
• 1.2 肠道病毒 71 型的分子生物学特征15-20
• 1.2.1 EV71 的一般特性及基因组结构特征15-17
• 1.2.2 EV71 的致病性及分子流行病学17-18
• 1.2.3 系统进化树18-20
• 第2章 实验研究20-44
• 2.1 材料和方法20-32
• 2.1.1 研究对象20
• 2.1.2 手足口病的诊断标准及病毒感染确诊20
• 2.1.3 试剂盒、工具酶和化学试剂20-22
• 2.1.4 主要仪器22
• 2.1.5 实验方法22-32
• 2.2 实验结果32-44
• 2.2.1 肠道病毒的鉴定32-35
• 2.2.2 分离得到的肠道病毒的分子生物学35-37
• 2.2.3 系统进化树分析及基因重组37-44
• 第3章 结论44-46
• 参考文献46-50
• 作者简介及在学期间所取得的科研成果50-51
• 致谢51

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本文编号：984309