发育性髋关节发育不良的遗传学研究

发布时间：2018-01-23 10:44

  本文关键词： 发育性髋关节发育不良 单核苷酸多态性 多态 时间飞行质谱 HOXD基因 DLX 基因 髋骨几何结构相关基因　出处：《天津医科大学》2015年博士论文　论文类型：学位论文

【摘要】：目的:本课题旨在研究发育性髋关节发育不良(developmental dysplasia of the hip,DDH)的可能候选基因,分别选取了病患样本中HOXD基因簇5’端基因,DLX3,4,5基因和髋骨几何结构相关基因的若干单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点,采用时间飞行质谱技术进行基因分型分析,与健康对照组及数据库进行比较,探讨其与DDH发生的相关性,希望为进一步揭示DDH的遗传学病因,为疾病的早期预防和诊断提供依据。方法:1.本研究结合目前在肢体发育机制方面的研究进展和DDH的主要病理改变,推测HOXD基因簇5’端基因可能是DDH相关的候选基因,运用飞行时间质谱的方法对HOXD基因簇5’端的的HOXD9,HOXD10,HOXD11和HOXD12等4个基因,共9个多态位点在210个DDH和174个匹配对照样本中进行基因分型分析。2.本研究结合连锁分析发现的DDH易感区域,区域内已知基因的分子生物学功能及DDH的主要病理改变推测有可能与DDH相关的候选基因,我们推测DLX家族成员可能是DDH的候选基因。运用飞行时间质谱的方法对DLX基因家族的3个基因:DLX 3,DLX4和DLX5,共8个多态位点在192个DDH和188个匹配对照样本中进行基因分型分析。3.本研究基于以往在骨研究领域与髋骨几何结构相关的全基因组关联分析(Genome Wide Association Study,GWAS)的研究结果,推测髋骨几何结构相关的基因可能是DDH的候选基因。我们选择选取与髋部骨骼发育相关的5个可能易感基因中的9个多态位点作为候选基因,运用飞行时间质谱的方法对这些多态位点在192个DDH和188个匹配对照样本中进行基因分型分析。结果:1.在9个SNPs位点中,5个位点与DDH密切相关,它们是HOXD9基因rs711819多态,HOXD10基因rs7601234多态,HOXD11基因rs6745764多态,HOXD11基因rs711815多态及HOXD12基因rs35817516多态。另外4个多态位点均与DDH不相关,它们分别是HOXD9基因rs711822多态,HOXD10基因rs78466921多态,HOXD10基因rs4972803多态及HOXD12基因rs711812多态。2.在8个SNPs位点中,5个位点与DDH密切相关,它们分别是DLX3基因的3个SNPs位点(rs2278163多态,rs12452477多态和rs2303466多态)和DLX4的2个SNPs位点(rs1058564多态和rs3760415多态)。另外,DLX5基因的3个单SNPs位点(rs12077335多态,rs9769385多态和rs35273378多态)均与DDH不相关。3.在9个SNPs位点中,4个位点与DDH密切相关,它们分别是VAMP1基因rs10492096,ZNF366基因rs10515148多态,PHACTR1基因rs4715166多态和PLCL1基因rs3771362多态。另外,RTP3基因rs10514713多态,RTP3基因rs7430431多态,PLCL1基因rs4850820多态,PLCL1基因rs4850833多态和PLCL1基因rs9789480多态均与DDH不相关。结论:1.我们首次发现HOXD9基因rs711819多态,HOXD10基因rs7601234多态,HOXD11基因rs6745764多态,HOXD11基因rs711815多态及HOXD12基因rs35817516多态等5个SNPSs位点与DDH密切相关。首次证明HOXD基因簇5’端基因(HOXD9,HOXD10,HOXD11及HOXD12)与DDH的相关性。2.我们首次发现DLX3的3个SNPs位点(rs2278163多态,rs12452477多态和rs2303466多态)和DLX4的2个SNPs位点(rs1058564多态和rs3760415多态),共5个SNPs位点与DDH密切相关。首次证明DLX3和DLX4基因可能与DDH的相关性。3.我们首次发现VAMP1基因rs10492096,ZNF366基因rs10515148多态,PHACTR1基因rs4715166多态和PLCL1基因rs3771362多态等4个SNPs位点与DDH密切相关。首次证明髋骨几何结构相关基因可能与DDH的相关性。
[Abstract]:Objective : To study the possible candidate genes of DDH , and to investigate the relationship between DDH and DDH . It is suggested that the 5 ' end gene of HOXD gene cluster may be a candidate gene of DDH . The polymorphisms of rs10492096 , rs12452477 polymorphism and rs3771362 polymorphism of the gene rs3771362 were closely related to DDH .

【学位授予单位】：天津医科大学
【学位级别】：博士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R681.1

【共引文献】

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本文编号：1457356