单核苷酸多态性与乳腺癌新辅助化疗疗效的关联研究

发布时间：2021-07-08 11:56

  目的利用甘肃省肿瘤医院乳腺科甘肃省乳腺病诊治中心和甘肃省医学科学院肿瘤组织和淋巴细胞库资源,用Taq Man Open Array基因分型系统联合检测与乳腺癌新辅助化疗密切相关的基因及其SNPs。通过以下方面进行深入研究:1.探讨甘肃汉族妇女乳腺癌患者新辅助化疗密切相关的基因的基因型分布。2.通过基因及其SNPs的研究,筛选新辅助化疗方案疗效和毒性相关的基因型分布。3.筛选与乳腺癌新辅助化疗方案疗效及预后相关的遗传标志物。方法依据不同的新辅助化疗方案遴选符合入组条件的乳腺癌病例,化疗前采集患者外周静脉血2 m L,利用北京百泰克公司DNA提取试剂盒提取基因组DNA;提取的DNA,采用ND 2000超微量分光光度计检测其浓度,要求所有DNA样本浓度为20~80ng/μL,OD值在1.7~2.0之间;分装于1.5 m L Eppendorf(EP)管中,-80℃冰箱保存备用;用美国应用生物系统(Applied Biosystems,AB)的Taq Man技术,采用Taq Man Open Array基因分型系统实施SNPs分析;所有患者按照RECIST标准评价疗效;随机选取5%的DNA样本送金维智公司进行PCR测序分析,以验证Taqman Openarray基因分型结果的可靠性;采用χ2检验比较各基因型化疗效果差异及疗效关系,分析基因型分布频率。结果1.MDR1 rs1045642各基因型频率分别为AA(18.1%),AG(41.8%),GG(40.1%);MDR1 rs1128503各基因型频率分别为AA(38.1%),AG(46.9%),GG(15.0%);CD44 rs187115各基因型频率分别为CC(8.6%),CT(29.8%),TT(61.6%)。2.186例乳腺癌新辅助化疗患者中,化疗受益(CR+PR)为82例,总有效率为44.1%;TNM分期中,II期患者比例为44.6%,III期患者比例为53.2%,IV患者比例为2.2%。卡方检验显示,患者年龄、TNM分期与化疗疗效均无明显相关性(p0.05)。3.在MDR1基因型rs1045642位点中,野生型(AA)、杂合型(AG)、突变型(GG)的受益率分别占总受益率的10.7%、17.5%、16.4%;AG型与AA型比较,差异无统计学意义(p=0.098),GG型与AA型比较,差异无统计学意义(p=0.081)。在MDR1基因型rs1128503位点中,野生型(AA)、杂合型(AG)、突变型(GG)的受益率分别占总受益率的21.1%,17.1%,5.4%;AG型与AA型比较,差异有统计学意义(p=0.032),提示AA型的化疗效果优于AG型,GG型与AA型比较,差异无统计学意义(p=0.131)。在CD44基因型rs187115位点中,野生型(CC)、杂合型(CT)、突变型(TT)的受益率分别占总受益率的4.0%,11.9%,28.5%;CT型与CC型比较,差异无统计学意义(p=0.692),TT型与CC型比较,差异无统计学意义(p=0.996)。4.MDR1 rs1045642 GG基因型与中性粒细胞减少症相关,III-IV度的发生率为2.8%(2/71),明显低于AA(9.4%)和AG型(20.3%),χ2=7.188,p=0.027。未发现MDR1 rs1045642多态性与血红蛋白减少、白细胞减少及血小板减少之间的关系。MDR1 rs1128503 GG基因型与中性粒细胞减少症相关,III-IV度的发生率为4.5%(1/22),明显低于AA(10.8%)和AG型(27.5%),χ2=9.077,p=0.011。未发现MDR1 rs1128503多态性与血红蛋白减少、白细胞减少及血小板减少之间的关系。CD44 rs187115 TT基因型与白细胞减少症相关,III-IV度的发生率为2.2%(2/93),明显低于CC(23.1%)和CT型(6.7%),χ2=10.194,p=0.006。未发现CD44 rs187115多态性与血红蛋白减少、中性粒细胞减少及血小板减少之间的关系。结论基因芯片检测方法简单快速且高通量,适用于大规模样本SNP调查;MDR1rs1045642位点、CD44 rs187115与化疗敏感性无关、MDR1 rs1128503位点AA型的化疗效果优于AG型,可能作为乳腺癌新辅助化疗敏感性的预测因子。



本文编号：1706539