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宽泛围PCR和宏基因组二代测序方法在人工关节感染微生物诊断中的应用

发布时间:2021-02-16 00:46
  人工关节感染(PJI)是人工关节置换术后最严重的并发症之一,PJI需要多次手术和长时间抗生素治疗,给患者和社会带来严重负担。及时、准确的微生物诊断是PJI治疗成功的关键。由于微生物在假体表面形成生物膜、浮游菌量少、微生物培养困难以及采样使用抗生素等原因,传统的微生物培养方法对病原微生物检出的阳性率低,且培养时间较长。临床常用的广谱的微生物分子诊断方法包括宽泛围PCR(BR-PCR)和宏基因组二代测序(mNGS),可不依赖培养、快速检出PJI标本中的病原微生物。这两种方法对关节液、假体周围组织及超声裂解液中病原微生物检出能力以及对PJI的诊断价值如何仍未明确。第一章宽泛围PCR方法对人工关节感染的微生物诊断价值【目的】研究宽泛围PCR(BR-PCR)方法对人工关节感染(PJI)患者关节液、假体周围组织和超声裂解液标本中的病原菌检出能力和对PJI的诊断价值。【方法】回顾性纳入人工关节翻修患者67例,分为PJI组和无菌性失败(AF)组。采样前均停用抗生素2周以上,每例患者均采集关节液、假体周围组织以及取出的假体的超声裂解液,所有标本类型均分别行微生物培养和BR-PCR,BRPCR扩增产物使用... 

【文章来源】:福建医科大学福建省

【文章页数】:119 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

宽泛围PCR和宏基因组二代测序方法在人工关节感染微生物诊断中的应用


超声裂解过程示意图

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20ABCDEF图1.1超声裂解过程示意图。图A取出的假体放入无菌可密封盒中,灭菌生理盐水没过假体表面;图B密封盒置于振荡仪上振荡,间歇性转动方向;图C密封盒置于超声清洗机的水浴槽内行超声裂解,间歇性转动方向;图D取超声裂解液离心后,弃上清取沉渣液;图E沉渣液行血平板培养;图F沉渣液行血培养瓶培养3.2微生物培养与鉴定液体标本(关节液、超声裂解液)取0.1ml使用血平板在培养箱行需氧和厌氧培养(35-37°C,5-7%CO2),需氧培养5-6天,厌氧培养10-14天(每日观测,培养阳性即停止)。余下的标本依次打入BD厌氧瓶、需氧瓶,在BD自动培养箱内培养(35-37°C,5-7%CO2,需氧培养5-6天,厌氧培养10-14天),报警后取出肉汤在血平板次代培养。假体周围组织剪碎并加入肉汤研磨后涂片行需氧菌、厌氧菌培养,培养条件与液体标本相同。使用MALDI-TOF质谱和VITEKII生化鉴定系统行微生物种属和药敏鉴定。血平板或血培养瓶培养阳性定义为:2份以上关节液或组织培养出相同微生物;超声裂解液培养阳性定义为:培养出如金黄色葡萄球菌、大肠埃希菌、链球菌属等高

分析图,分析图,凝胶电泳


PCR扩增产物凝胶电泳分析图

【参考文献】:
期刊论文
[1]二代测序技术在人工关节感染关节液病原菌检测中的应用[J]. 王启金,黄子达,方心俞,白国昌,李孟庆,张泽宇,李文波,张文明.  中华骨科杂志. 2018 (11)
[2]人工关节假体周围感染的微生物学分析[J]. 邵宏翊,郭宇,周一新,郑汉龙.  骨科临床与研究杂志. 2017(04)
[3]髋关节置换术后感染的微生物特点及药敏分析[J]. 孙长鲛,周勇刚,柴伟,王岩.  中华医学杂志. 2014 (21)
[4]超声裂解在人工关节置换术后假体周围感染诊断中的作用[J]. 白国昌,曾慧意,李文波,黄子达,杨滨,林建华,张怡元,李炜明,王武炼,张文明.  中华骨科杂志. 2014 (06)
[5]膝关节置换术后感染病原菌分布及耐药性分析[J]. 贺占坤,杨勇,许丹,沈杰威.  中华医院感染学杂志. 2014(01)



本文编号:3035830

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