成人退变性脊柱侧凸lncRNA差异表达基因及相关生物信息学的研究

发布时间：2021-03-04 23:19

　　[目的]采用高通量RNA测序（RNA-seq）技术,检测成人退变性脊柱侧凸（ADS）、腰椎间盘突出症（LDH）和健康成人（Normal）的长链非编码RNA（lncRNA）基因表达谱,对照分析成人退变性脊柱侧凸的lncRNA差异基因表达谱,探寻成人退变性脊柱侧凸的lncRNA可能关键差异表达基因及相关分子功能和生物学信号通路,为进一步研究成人退变性脊柱侧凸的发生发展机制及开发特定的分子生物标志物和精准靶向治疗提供理论基础。[方法]1.采用高通量RNA测序（RNA-Seq）技术,对通过伦理审核后采取的ADS组（n=3）、LDH组（n=3）、Normal组（n=3）三组共九个外周全血样本进行lncRNA测序。将上述三组样本测序结果分别进行两两组间比较,然后将上述三组两两组间比较结果及ADS_vs_Normal和ADS_vs_LDH两组组间比较结果利用维恩图描绘交集,筛选共同差异表达基因,以描绘ADS的差异基因表达谱,最终筛选ADS可能的关键差异表达基因。2.对筛选出的ADS差异表达基因进行进一步的生物信息学分析,... 

【文章来源】：昆明医科大学云南省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１?ＬｎｃＲＮＡ筛选统计图??３．２编码潜能筛选维恩图??

图２筛选结果维恩图??

ＦＰＫＭ?ｄｅｎｓｉｔｙ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??１．５?ｉ??ｌ?Ｇｒｏｕｐ??？＾１．０－?＼?Ｎｏｒｍａｌ??Ｉ?＼?部ＨＳ??－Ｖ??０．０－：??＾?ｌｏｇ，〇＜ＦＰＫＭ＋”“??图５：?ＦＰＫＭ密度分布图??注：由图４、５可以看出，Ｎｏｒｍａｌ、ＬＤＨ、ＡＤＳ三组ＩｎｃＲＮＡ表达水平差异??不大。??４．４样品间表达相关性检查??相关系数越接近１，表明样品之间表达模式的相似度越高。检查结果如图６??所示：??Ｐｅａｒｓｏｎ?ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏ门?ｂｅｔｗｅｅｎ?ｓａｍｐｌｅｓ??Ｎｏｒｍａｌ?３－?０．８１９?０．８１６?０．７７１?０．８１６?０，８３１?０．８２５?０．８１?０．８２３｜?１??Ｎｏｒｍａｌ?２－?０．８０８?０．７９６?０．７６?０．８３３?０．８２１?０．８０３?０．７９３１?１?Ｉ０－８２３??Ｎｏｒｍａｌ?１?－?０．８２?０．８１７?０．７３１?０．７７６?０．８２１?０．８２?１?１?０．７９３?０．８１??ＬＤＨ＿３－?０．８２４?０．８２６?０．７４４?０．７９８?０．８２９?０．８２?０．８０３?０．８２５?＿?１０??ＬＤＨ?２－?０．８３２?０．８１８?０．７４６?０．８１?丨?１?０．８２９?０．８２１?０．８２１?０．８３１?０?９??ＬＤＨ—ｉ?０．７９７?０．７７７?０．７６３?｜?１?０．８１?０．７９８?０．７７６?０．８３３?０．８１６?°＇８??ＡＤＳ＿３?－?０．７２６?０．７５４?Ｉ?１?Ｉ?０．７６３?０．７４６?０．７４４?０．７３１?０．７６?０．７７１??ＡＤＳ?２?０．８１７?１?Ｉ?０．７５４?０．７

【参考文献】：
期刊论文
[1]Noncoding RNAs in cancer and cancer stem cells[J]. Tianzhi Huang,Angel Alvarez,Bo Hu,Shi-Yuan Cheng.  Chinese Journal of Cancer. 2013(11)



本文编号：3064117