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黄韧带骨化过程中ncRNA与mRNA的交互作用网络及miR-342-3p促成骨分化的作用机制

发布时间:2021-04-16 08:21
  已有研究表明非编码RNA可参与多种生理病理过程,其在疾病的发生发展中发挥重要作用。黄韧带骨化症及骨质疏松症是常见的慢性骨科疾病,如不能得到及时的诊断和治疗,将严重影响患者的生存质量。目前,鲜有报道非编码RNA在黄韧带骨化症或骨质疏松症中的功能及机制。本研究旨在通过基因芯片或测序筛选出骨化黄韧带组织(Ossification of ligamentum flavum,OLF)中显著差异表达的m RNA、lnc RNA、mi RNA及circ RNA,并对差异RNA进行关联分析及功能探究;同时明确mi R-342-3p在成骨分化中的功能及机制,为黄韧带骨化和骨质疏松症的诊断和治疗提供新思路。方法:1.标本采集:收集术中取出的新鲜骨化的黄韧带组织和正常黄韧带组织。用液氮研磨法快速提取组织样本RNA,并通过RNA电泳和2100质量检测法进行检测。从中分别选4个合格的正常黄韧带组织和4个合格的骨化黄韧带组织的RNA进一步实验。2.筛选OLF中差异表达的m RNA:通过基因芯片分析,OLF与正常黄韧带组织(ligamentum flavum,LF)相比,筛选出差异倍数>2,p<0.05... 

【文章来源】:天津医科大学天津市 211工程院校

【文章页数】:129 页

【学位级别】:博士

【部分图文】:

黄韧带骨化过程中ncRNA与mRNA的交互作用网络及miR-342-3p促成骨分化的作用机制


骨化黄韧带组织中差异mRNAs的表达谱

黄韧带骨化过程中ncRNA与mRNA的交互作用网络及miR-342-3p促成骨分化的作用机制


OLF中差异mRNAs的GO和KEGG分析

表达谱,黄韧带,验证结果,芯片


在扩大样本中,进一步 qPCR 验证。上述 10 个差异 lncRNAs 在芯片结果中的差异如表 1.2,qPCR 验证结果如图1.3 B,结果表明验证结果与芯片结果一致,说明芯片结果可信。进一步对差异 lncRNA 种类进行分析,结果如图 1.3 C 所示,intergeniclncRNA 占总差异 lncRNAs 的 62.45%、intronic antisense 占 13.28%、naturalantisense 占 11.38%、bidirectional 占 6.16%、intron sense-overlapping 占 4.95%及exon sense-overlapping 占 1.79%。根据不同长度,对差异 lncRNA 进行分类,结果如图 1.3 D 所示,差异 lncRNA 主要集中在 200 至 1000bp 之间。已有研究表明,染色质分布失衡与多种疾病相关[53]。我们依据每条染色体上差异 lncRNA和 mRNA 的数目对相应染色体的长度分别做标准化后

【参考文献】:
期刊论文
[1]Culture conditions for equine bone marrow mesenchymal stem cells and expression of key transcription factors during their differentiation into osteoblasts[J]. Elizabeth R A Glynn,Alfredo Sanchez Londono,Steven A Zinn,Thomas A Hoagl,Kristen E Govoni.  Journal of Animal Science and Biotechnology. 2014(02)
[2]Mesenchymal stem cells: Molecular characteristics and clinical applications[J]. Farbod Rastegar,Deana Shenaq,Eric R Wagner,Stephanie H Kim,Russell R Reid,Hue H Luu,Rex C Haydon.  World Journal of Stem Cells. 2010(04)



本文编号:3141080

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