LncRNA A2M-AS1促进乳腺癌增殖、侵袭和迁移，并与患者预后不良有关

发布时间：2021-06-14 19:46

　　目的:研究长链非编码RNA（Long non-coding RNA,lncRNA）A2M-AS1在乳腺癌（Breast cancer,BC）中差异表达的临床意义,分析其对乳腺癌细胞增殖、侵袭和迁移的影响,并初步探讨其潜在的分子机制。方法:1、从GEO（Gene expression omnibus）数据库中下载乳腺癌基因测序的原始数据,利用R语言筛选出所有差异表达的mRNAs和lncRNAs,并分析A2M-AS1在乳腺癌中差异表达的临床意义。2、在收集的96例人乳腺癌组织和64例癌旁组织中,采用实时荧光定量PCR（Real time fluorescence quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR）检测A2M-AS1的表达水平。3、根据A2M-AS1表达的平均值,将A2M-AS1分为高表达组和低表达组,Kaplan-meier分析A2M-AS1高低表达与乳腺癌预后的相关性。4、CCK-8实验检测A2M-AS1对乳腺癌细胞增殖的影响。5、Transwell和划痕实验检测A2M-AS1对乳腺癌细胞侵袭和迁移的影响。6、分别敲降和过表达A... 

【文章来源】：江南大学江苏省 211工程院校 教育部直属院校

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【学位级别】：硕士

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GEO数据集中乳腺癌中的差异表达基因和lncRNAsFigure1.DifferentialexpressedgenesandlncRNAsinbreastcancerinGEOdataset注：A：GSE45827数据库中通过层次聚类鉴定的399个差异表达的lncRNA和11070个差异表达的

图 1. GEO 数据集中乳腺癌中的差异表达基因和 lncRNAsFigure 1. Differential expressed genes and lncRNAs in breast cancer in GEO dataset注：A：GSE45827 数据库中通过层次聚类鉴定的 399 个差异表达的 lncRNA 和 11070 个差异表达的mRNA 的火山图。B：GSE65216 数据库中通过层次聚类鉴定的 383 个差异表达的 lncRNA 和 11164个差异表达的 mRNA 的火山图。2.2.2 A2M-AS1 在乳腺癌中的差异表达在筛选实验中，我们下载了 GSE45827 和 GSE65194 数据集，其中 GSE45827 包括167 例肿瘤组织和 11 例癌旁组织。GSE65194 包括 306 例肿瘤组织和 22 例癌旁组织。经分析发现 lncRNAA2M-AS1 在乳腺癌组织中较相邻非癌组织中表达上调（图 2），且具有显著差异。

江南大学硕士学位论文.3 A2M-AS1 表达与乳腺癌临床病理特征的相关性进一步研究 A2M-AS1 与乳腺癌临床病理参数之间的关系，发现 A2M-AS1 在 E组织中较 ER 阳性组织中显著高表达，差异具有统计学意义（P=0.0028）（图 3A外，A2M-AS1 在基底样（P=0.0081）和 HER-2 +（P =0.0209）组织中的表达高腔 B 乳腺癌组织（图 3 B）, 而基底样 (n=30)和 HER-2 +(n=41)乳腺癌组织之M-AS1 表达的差异无显著性（P> 0.05）。


本文编号：3230212