瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad通路与Egr1相关性的研究
发布时间:2021-10-13 22:47
背景:瘢痕疙瘩是真皮中成纤维细胞过度增殖和细胞外基质过量沉积引起的皮肤纤维性良性肿瘤,也是一种由皮肤损伤和刺激引起的异常伤口愈合反应。由于瘢痕疙瘩的具体发病机制尚不明确,限制了临床治疗。现由于其高复发率对外科医生仍然是一个巨大的挑战。早期生长反应因子1(Egr1)作为一种重要的转录因子,已被证实在多种生理病理途径中发挥重要作用,其异常表达与多种人类疾病进程相关,包括癌症、炎症、动脉粥样硬化和一些纤维化疾病等。异常表达的Egr1可能通过调控下游与炎症、免疫反应类型、细胞增殖和凋亡和EMT等相关的靶基因,从而影响瘢痕疙瘩的发病。现已有大量研究证实了瘢痕疙瘩的中TGF-β1/smad信号传导通路的异常高活化。并且也有研究证实了在硬皮病、肺纤维化和结肠炎的动物模型中,TGF-β1可以通过TGF-β1/smad信号通路的上调Egr1的表达,但在瘢痕疙瘩中,TGF-β1/smad信号通路的与Egr1的关系尚未明确。目的:旨在探究人瘢痕疙瘩中TGF-β1/smad信号通路与Egr1的表达变化的相关性,为阐明TGF-β1/smad信号通路与Egr1相互作用的分子机制奠定基础,从而为瘢痕疙瘩治疗提供新理...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.3:分组图示
第3章实验结果18第3章实验结果3.1人瘢痕疙瘩mRNA表达谱3.1.1人瘢痕疙瘩差异基因表达变化利用基因芯片技术检测人瘢痕疙瘩及正常皮肤中的基因表达谱,从而筛选出差异基因。结果显示:三组样本中,有众多表达差异明显的基因(见图3.1),其中与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤中有777个基因上调,568个基因下调;与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤有962个基因上调,464个基因下调;与正常皮肤相比,距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤有37个基因上调,173个基因下调(见图3.2)。图3.1人瘢痕疙瘩差异基因层次聚类热图(mRNA)(横坐标为样本,纵坐标为差异基因,左侧根据表达相似程度对基因进行聚类,上方根据表达谱的相似程度对每个样本进行聚类,由蓝至红表达量逐渐上调。K:瘢痕疙瘩中央区域皮肤,S:距瘢痕疙瘩边缘大于3mm的皮肤,N:非瘢痕疙瘩体质人的正常皮肤。)
第3章实验结果19图3.2人瘢痕疙瘩差异基因火山图(mRNA)(横坐标表示基因在不同样本或比较组合间的表达倍数变化(log2FoldChange),横坐标的绝对值越大表明两个比较组合之间的表达变化倍数越大;纵坐标表示表达差异的显著性水平。表达上调基因用红色点表示,下调基因用绿色点表示,蓝色点为未发生显著变化的基因。Keloid:瘢痕疙瘩中央区域皮肤,sNskin:距瘢痕疙瘩边缘大于3mm皮肤,Nskin:非瘢痕疙瘩体质人的正常皮肤。)3.1.2人瘢痕疙瘩差异基因富集区域相关生物学功能根据综合数据库,分析差异基因富集区域相关生物学功能(见图3.3)。将所有差异基因分成生物过程、细胞组分及分子功能三大类,结果显示:①生物过程:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的生物过程包括细胞外基质形成、骨骼系统形成、细胞外基质降解、胶原代谢过程等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的生物过程包括细胞外基质形成、细胞外基质降解、多细胞生物大分子等。②细胞组分:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的细胞组分包括细胞外基质、蛋白细胞外基质、肌原纤维、胶原收缩等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的细胞组分包括细胞外基质、蛋白细胞外基质、细胞外基质分子、内质网腔等。③分子功能:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的分子功能包括细胞外基质结构组成、胶原结合、肌肉结构组成、糖胺聚糖结合等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的分子功能包括细胞外基质结构组成、胶原结合、糖胺聚糖结合、生长因子结合等。3.1.3人瘢痕疙瘩差异基因富集区域相关信号传导通路(TGF-β信号?
本文编号:3435547
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:54 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.3:分组图示
第3章实验结果18第3章实验结果3.1人瘢痕疙瘩mRNA表达谱3.1.1人瘢痕疙瘩差异基因表达变化利用基因芯片技术检测人瘢痕疙瘩及正常皮肤中的基因表达谱,从而筛选出差异基因。结果显示:三组样本中,有众多表达差异明显的基因(见图3.1),其中与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤中有777个基因上调,568个基因下调;与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤有962个基因上调,464个基因下调;与正常皮肤相比,距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤有37个基因上调,173个基因下调(见图3.2)。图3.1人瘢痕疙瘩差异基因层次聚类热图(mRNA)(横坐标为样本,纵坐标为差异基因,左侧根据表达相似程度对基因进行聚类,上方根据表达谱的相似程度对每个样本进行聚类,由蓝至红表达量逐渐上调。K:瘢痕疙瘩中央区域皮肤,S:距瘢痕疙瘩边缘大于3mm的皮肤,N:非瘢痕疙瘩体质人的正常皮肤。)
第3章实验结果19图3.2人瘢痕疙瘩差异基因火山图(mRNA)(横坐标表示基因在不同样本或比较组合间的表达倍数变化(log2FoldChange),横坐标的绝对值越大表明两个比较组合之间的表达变化倍数越大;纵坐标表示表达差异的显著性水平。表达上调基因用红色点表示,下调基因用绿色点表示,蓝色点为未发生显著变化的基因。Keloid:瘢痕疙瘩中央区域皮肤,sNskin:距瘢痕疙瘩边缘大于3mm皮肤,Nskin:非瘢痕疙瘩体质人的正常皮肤。)3.1.2人瘢痕疙瘩差异基因富集区域相关生物学功能根据综合数据库,分析差异基因富集区域相关生物学功能(见图3.3)。将所有差异基因分成生物过程、细胞组分及分子功能三大类,结果显示:①生物过程:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的生物过程包括细胞外基质形成、骨骼系统形成、细胞外基质降解、胶原代谢过程等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的生物过程包括细胞外基质形成、细胞外基质降解、多细胞生物大分子等。②细胞组分:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的细胞组分包括细胞外基质、蛋白细胞外基质、肌原纤维、胶原收缩等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的细胞组分包括细胞外基质、蛋白细胞外基质、细胞外基质分子、内质网腔等。③分子功能:与正常皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的分子功能包括细胞外基质结构组成、胶原结合、肌肉结构组成、糖胺聚糖结合等。与距瘢痕疙瘩边缘大于3mm区域皮肤相比,瘢痕疙瘩中央区域皮肤差异基因富集的分子功能包括细胞外基质结构组成、胶原结合、糖胺聚糖结合、生长因子结合等。3.1.3人瘢痕疙瘩差异基因富集区域相关信号传导通路(TGF-β信号?
本文编号:3435547
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