胆总管结石患者胆道菌群结构及其与胆总管结石复发的关系研究
发布时间：2021-12-11 15:25
目的:探讨胆总管结石患者胆道菌群的结构组成、多样性及其与胆总管结石复发的关系。方法:选取2018年9月至2018年11月因胆总管结石在兰州大学第一医院ERCP诊疗中心接受ERCP手术治疗的患者23例,其中初发性胆总管结石患者14例,复发性胆总管结石患者9例。收集所有患者的基本资料、病史资料以及术前检验结果,并于ERCP术中采集胆总管胆汁样本。提取所有样本的微生物DNA,进行PCR扩增,采用16S rDNA高通量测序技术进行测序分析,鉴定细菌OTU。通过物种分类注释,揭示胆总管结石患者胆道菌群的结构组成及其多样性,对比分析复发性与初发性胆总管结石患者胆道菌群的差异。结果:胆总管结石患者胆总管胆汁中细菌DNA检出率为100%。研究共获得579 599个高质量tags,平均每个样本25 200±11 429个tags,其中初发性胆总管结石获得325 559个tags,复发性胆总管结石获得个254 040个tags。经鉴定获得1075个细菌OTUs,平均每个样本191±66个OTUs,其中初发性胆总管结石获得830个OTUs,复发性胆总管结石获得824个OTUs。依据物种分类注释结果,所有OT...
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
所有样本序列长度分布
位论文 胆总管结石患者其与胆总管结石续表 2.2 所有样本测序数据统计w Tags Raw Bases Valid Tags Valid Bases(M315 18.25M 29726 12.32 957 16.83M 24956 9.99 512 17.16M 27718 11.49 067 10.88M 17458 7.23 345 14.05M 22791 9.45 528 9.95M 13874 5.65 803 10.12M 16457 6.84
图 2.2 两组样本 α 多样性指数比较（Chao l 和 Shannon 指数）图 2.3 各样本及组间比较的稀释曲线（Observed species 指数）。横坐标表示随机抽取的序列数，纵坐标表示与之对应的 OTU 数，用以反映测序深度。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Endoscopic treatment of difficult extrahepatic bile duct stones, EPBD or EST: An anatomic view[J]. Jun Ding,Fu Li,Hong-Yi Zhu,Xi-Wen Zhang. World Journal of Gastrointestinal Endoscopy. 2015(03)
[2]肝内胆管结石和胆汁中细菌多样性分析[J]. 刘敏,彭宇鸿,余宇,高强,王瑞丰,田伏洲,孙群. 四川大学学报(自然科学版). 2014(03)
[3]常见三种类型胆结石胆汁中细菌群落的检测[J]. 刘晶华,王敏,邹玉. 临床肝胆病杂志. 2012(07)
[4]Concept of the pathogenesis and treatment of cholelithiasis[J]. Vasiliy Ivanovich Reshetnyak. World Journal of Hepatology. 2012(02)
[5]豚鼠胆色素结石模型的肠道免疫屏障研究[J]. 于浩,俊金哲,吴硕东. 中国医科大学学报. 2010(03)
[6]胆红素钙结石形成的机制研究[J]. 蔡红娇,裘法祖. 中华实验外科杂志. 2006(11)
[7]聚合酶链式反应和常规培养检测胆总管结石中细菌及其意义的研究[J]. 陈晓文,智发朝,武金宝,万田谟,周丹. 临床肝胆病杂志. 2005(03)
[8]胆石病流行病学研究的现状和发展[J]. 韩天权,张圣道. 胃肠病学. 2003(03)
[9]Relationship between bilirubin free radical and formationof pigment gallstone[J]. Xiang-Tao Liu Jian Hu,Department of Chemical Biology,School of Pharmaceutical Sciences,Peking University,Beijing 100083,China. World Journal of Gastroenterology. 2002(03)
[10]New development of biliary surgery in China[J]. Zhi Qiang Huang The Research Institute of General Surgery,The General Hospital of PLA,Beijing 100853,China. World Journal of Gastroenterology. 2000(02)
本文编号：3534919
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：61 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
所有样本序列长度分布
位论文 胆总管结石患者其与胆总管结石续表 2.2 所有样本测序数据统计w Tags Raw Bases Valid Tags Valid Bases(M315 18.25M 29726 12.32 957 16.83M 24956 9.99 512 17.16M 27718 11.49 067 10.88M 17458 7.23 345 14.05M 22791 9.45 528 9.95M 13874 5.65 803 10.12M 16457 6.84
图 2.2 两组样本 α 多样性指数比较（Chao l 和 Shannon 指数）图 2.3 各样本及组间比较的稀释曲线（Observed species 指数）。横坐标表示随机抽取的序列数，纵坐标表示与之对应的 OTU 数，用以反映测序深度。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Endoscopic treatment of difficult extrahepatic bile duct stones, EPBD or EST: An anatomic view[J]. Jun Ding,Fu Li,Hong-Yi Zhu,Xi-Wen Zhang. World Journal of Gastrointestinal Endoscopy. 2015(03)
[2]肝内胆管结石和胆汁中细菌多样性分析[J]. 刘敏,彭宇鸿,余宇,高强,王瑞丰,田伏洲,孙群. 四川大学学报(自然科学版). 2014(03)
[3]常见三种类型胆结石胆汁中细菌群落的检测[J]. 刘晶华,王敏,邹玉. 临床肝胆病杂志. 2012(07)
[4]Concept of the pathogenesis and treatment of cholelithiasis[J]. Vasiliy Ivanovich Reshetnyak. World Journal of Hepatology. 2012(02)
[5]豚鼠胆色素结石模型的肠道免疫屏障研究[J]. 于浩,俊金哲,吴硕东. 中国医科大学学报. 2010(03)
[6]胆红素钙结石形成的机制研究[J]. 蔡红娇,裘法祖. 中华实验外科杂志. 2006(11)
[7]聚合酶链式反应和常规培养检测胆总管结石中细菌及其意义的研究[J]. 陈晓文,智发朝,武金宝,万田谟,周丹. 临床肝胆病杂志. 2005(03)
[8]胆石病流行病学研究的现状和发展[J]. 韩天权,张圣道. 胃肠病学. 2003(03)
[9]Relationship between bilirubin free radical and formationof pigment gallstone[J]. Xiang-Tao Liu Jian Hu,Department of Chemical Biology,School of Pharmaceutical Sciences,Peking University,Beijing 100083,China. World Journal of Gastroenterology. 2002(03)
[10]New development of biliary surgery in China[J]. Zhi Qiang Huang The Research Institute of General Surgery,The General Hospital of PLA,Beijing 100853,China. World Journal of Gastroenterology. 2000(02)
本文编号：3534919
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