成人退变性脊柱侧凸相关circRNA的筛选及其生物学功能的初步研究

发布时间：2025-03-31 23:22

　　[目的]通过高通量测序技术分析成人退变性脊柱侧凸（Adult degenerative scoliosis,ADS）患者外周血中转录组circRNA基因表达谱,筛选出差异表达的circRNA,对差异性表达的circRNA进行生物学信息分析。构建circRNA-miRNA相互调控作用网络图,寻找差异性表达的circRNA与miRNA结合位点,探讨差异性表达的circRNA在ADS患者中的生物学功能,并发现灵敏度及特异度高的潜在诊断标志物,为深入认识ADS在转录组学层面的发生发展机制及诊治提供理论基础。[方法]收集ADS患者、腰椎间盘突出症患者（Lumbar disc herniation,LDH）、健康对照者外周血5ml,每组各3例。提取样本总RNA,利用NanoDropND-1000超微量分光光度计检测总RNA的浓度及纯度,变性琼脂糖凝胶电泳检测总RNA的完整性。根据总RNA质检结果,符合高通量测序技术要求后,利用第二代高通量Illumina HiSeq测序技术平台检测外周血中转录组circRNA的表达谱,筛选出差异性表达的circRNA。对差异表达的circRNA进行火山图分析、聚类分...

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１所有样本总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ为Ｔｒａｎｓ?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，图中对应上样序列为１－９原液上样ｌｕｌ??图１所有样本总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表达谱分析??２．１统计原始序列数据??高通量测序得到的原始测序结果，其序列中可能含....

图２ＡＤＳ＿１原始测序序列类型??２７??

■ＢｉＢｉＢ??■ＨＨｉ??注：Ｍａｒｋｅｒ为Ｔｒａｎｓ?２Ｋ?Ｐｌｕｓ，图中对应上样序列为１－９原液上样ｌｕｌ??图１所有样本总ＲＮＡ琼脂糖凝胶电泳??２ＡＤＳ、ＬＤＨ外周全血中ｃｉｒｃＲＮＡ的表达谱分析??２．１统计原始序列数据??高通量测序得到的原始测序结果，其序列中可能含....

图４ＡＤＳ—３原始测序序列类型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＡＤＳ＿２）??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４４２９５９２４，?９５．９３％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（７３１６２，?０．１６％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９１０１，?０．７６％）??Ａｄａｐｔｅｒ?Ｒｅｌａｔｅ....

图６?ＬＤＨ＿２原始测序序列类型??

Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ?ｏｆ?Ｒａｗ?Ｒｅａｄｓ（ＬＤＨ＿ｌ）??，１?＿??Ｃｌｅａｎ?Ｒｅａｄｓ?（４６５９２５３７，?９５．８９％）??Ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ?Ｎ?（６２３１０１，?１．２８％）??Ｌｏｗ?Ｑｕａｌｉｔｙ?（３４９３８３，?０．７２％）??Ａｄａｐｔｅｒ....

本文编号：4038575