Waardenburg综合征模型猪的血管纹发育及转录组学分析

发布时间：2020-12-13 02:14

　　Waardenburg综合征2A型是一种常见的遗传性耳聋,主要是由Mitf基因突变造成神经嵴细胞来源的黑色素细胞发育不良、黑色素合成减少引起,表现为全身性的色素沉积不足,其中由于内耳血管纹黑色素细胞源性的中间细胞（intermediate cells）缺失导致耳蜗内淋巴电位消失,并继发广泛的毛细胞损伤,最终表现为重度感音神经性耳聋。Mitf-M基因自发突变的模型猪与人类Waardenburg综合征2A型表型一致,即色素缺失、听觉功能和内耳形态学与电生理学缺陷,其耳蜗发育与听觉形成过程相较于小鼠模型更接近人类。本研究基于该模型开展耳蜗血管纹的形态学和分子生物学分析,为血管纹发育及损伤相关疾病的致病机理和干预途径提供参考。血管纹是由边缘细胞、中间细胞、基底细胞和毛细血管网等组成的高度血管化组织,在维持耳蜗内电位、离子转运循环中发挥着重要作用,既往研究主要认为Mitf具有支持中间细胞的存活、维持血管纹结构完整的功能,但对于Mitf作为转录因子如何涉及血管纹功能和听觉形成尚未深入的研究,因此本研究利用RNA-Seq测序方法、免疫荧光技术及电镜等技术,分析Mitf基因参与的生物学过程、通路及在形... 

【文章来源】：中国人民解放军医学院北京市

【文章页数】：85 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１．?１为ＲＮＡ－Ｓｅｑ相关性分析，Ｒ为ｐｅａｒｓｏｎ相关系数的平方

??２．猪血管纹差异基因富集的ＫＥＧＧ通路??差异基因表达的ＫＥＧＧ通路主要富集在：①ＰＩ３Ｋ－ＡＫＴ信号通路??（ｍｍｕ０４１５１，ＰＩ３Ｋ－ＡＫＴ?ｓｉｇｎａｌｉｎｇ?ｐａｔｈｗａｙ），基因有／ｆｏｐ、／故从、／攻“５、??Ｃｏ／７心、Ｇ＿ｙＷ、Ｃｂ／义７、ｋｍＷ、Ｃｂ／５？２、７７ｚＺｘ＾、②细胞－基质粘附??（Ｍｍｕ０４５１０，ＦｏｃａｌＡｄｈｅｓｉｏｎ），基因有／＆甲、／，ｇ沾、／你ｚＳ、０？／７Ｗ、Ｃｂ／２“７、Ｃｂ／７ｄ、??ＺａｍＷ、Ｃｂ／５（ｚ２、７７＾４、／＾ｌ；③蛋白质消化吸收（Ｍｍｕ０４９７４，Ｐｒｏｔｅｉｎ?Ｄｉｇｅｓｔｉｏｎ??Ａｎｄ?Ａｂｓｏｒｐｔｉｏｎ），基因有Ｃｂ／７ａ７、Ｃｂ／７７“７、ｄ／ｐ７６２、Ｃｂ／７？２、Ｍｗｅ、??Ｃｂ／２“７、Ｃｂ／５ｆｌ２、④Ｅｃｍ－受体相互作用（Ｍｍｕ０４５１２，Ｅｃｍ－Ｒｅｃｅｐｔｏｒ?Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ），??基茵韦Ｉｂｓｐ、Ｉｔｇｂ８、Ｉｔｇａ８、Ｃｏｌｌａ２、Ｃｏｌ２ａｌ、Ｃｏｌｌａｌ、Ｌａｍｂｌ、Ｃｏｌ５ａ２、Ｔｈｂｓ４、ＦｎＵ??⑤代谢途径（ＭｍｕＯｌ?１００，Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ?Ｐａｔｈｗａｙｓ），基因有Ｄｃ／、ｄＷＷ、ＣＷｃ八?３＞ｒ、Ｃｂｘ？、??Ｃｏｘ／、Ｊｏｘ／、ＣＡ／７〇。如图?１．３所示。??

３．差异基因ＧＯ功能富集分析及ＫＥＧＧ信号通路的聚类分析??在ＤＡＶＩＤ数据库中分析差异基因，得出ＧＯ功能及ＫＥＧＧ信号通路的聚类分析。如??图１．４所示，可发现ＧＯ功能最主要富集在细胞组分的黑色素小体（Ｇ０：００４２４７０）、黑??色素膜（Ｇ〇：００３３１６２）、和生物学过程的黑色素分泌过程（Ｇ０：００４２４３８）以及ＫＥＧＧ??通路的ＰＩ３Ｋ－ＡＫＴ信号通路（＿ｕ０４１５１）、细胞－基质粘附（＿ｕ０４５１０）、蛋白质消化??吸收（ｍｍｕ０４９７４）、ＥＣＭ－受体相互作用（ｍｍｕ０４５１２）。??１９??


本文编号：2913700