竞争性内源RNA网络识别喉癌复发中的特征性微小RNA和长链非编码RNA

发布时间：2020-12-14 09:26

　　背景喉癌是耳鼻咽喉科最多见的癌症之一,声门型最为多见,鳞状细胞癌是其主要病理类型。世界卫生组织（world health organization,WHO）官方的数据表明,虽然喉癌发病率和死亡率略有下降,但其发病人数在全球范围内却不断上升。随着对生活质量要求的提高、研究的不断深入和科技的发展,我们对于喉的功能保留和重建有了更高的追求,治疗方案在不断改进。然而,这些努力并没有提高总体生存率,在美国,喉癌是为数不多的在过去40年内5年生存率下降的肿瘤。复发是喉癌治疗失败的主要表现,复发喉癌患者的预后非常差。了解喉癌发病、复发的分子机制,寻找分子的靶向位点,有助于制定新的、更有效的治疗策略。目的鉴别喉癌复发中的特征性微小核糖核酸（microRNA,miRNA）和长链非编码核糖核酸（long non-coding RNA,lncRNA）,并研究其与喉癌复发相关的调控机制。方法从TCGA数据库和GEO数据库下载复发和非复发的喉癌样本数据。检测差异表达的miRNA（differentially expressed microRNA,DE-miR）、差异表达的lncRNA（differentiall... 

【文章来源】：广西医科大学广西壮族自治区

【文章页数】：109 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

筛选得到的DEG、DE-lncR及DE-miR的表达值热图

表达的 miRNA，如表 3-4 所示，最终构建出 4 个疾病特征性的 lncR 7 个 miRNA 之间的调控关系。构建的 lncRNA-miRNA 调控网络如图示。网络中方形和菱形的节点分别表示 lncRNA 和 miRNA，红色和绿别表示显著上调和下调表达。表 3-4. 复发相关的 lncRNA 靶向调控的显著差异表达的 miRNATable 3-4. DE-lncRNAs and tageted DE-miRNAslncRNA Targeted miRNAsEMX2OS miR-184,miR-124HCG4 miR-1,miR-33b,miR-133aHOTAIR miR-33b,miR-1,miR-208a,miR-499,miR-124,miR-133aTTTY15 miR-33b,miR-124,miR-1

竞争性内源RNA网络识别喉癌复发中的特征性微小RNA和长链非编码RNA 博士学位论文ACTC1 ALPI POU4F1 MGST1 XIRP1hsa-miR-184 SOX1 ZDHHC22 CLDN6 LMAN1L FMN2 TAC4 SHISA6hsa-miR-208aRGS7 MYOZ2 C17orf64 LTF TTN PIK3C2G FLRT3 PRUNE2 CLDN22 TRDN TMC5GABRA2 ATP1A2 DMRTC1 TECRL SHISA6 AGR3hsa-miR-33bSLC30A8 CALCA MKRN3 MDGA2 ADAMTS19 ABRA AWAT2 CHRNA1 MAGEB1PPP1R3A PCP4 ADD2 SHISA6 IBSP SLC5A5 PKHD1 APOBEC2 AADACL3 VGLL2FGF5 OPCML MAGEA2 TSPY2 AMBN SLC1A6 C10orf82 CSMD3 CALCB MYPNTECRL MYOZ2 ZNF695 VWA3A EPO MYH1 DEFA5 ASB10 UPK1B PIK3C2GSLITRK4 KY FAM90A1 NEFL BEST3 NXF2 GDF6 CYP3A43 ANO4 DIRAS2 FAM9CTMEFF2 DLK1 BRDT ANKRD1 PTH2R GRIK2 NRK SERPINB11 TTN TSPY3MYO3A SCN5A BPY2 STATH HTN3 FMN2 CPNE4 MASP1 ZNF208

【参考文献】：
期刊论文
[1]ABO blood group is a predictor of survival in patients with laryngeal cancer[J]. Ting Jin,Pei-Jing Li,Xiao-Zhong Chen,Wei-Han Hu.  Chinese Journal of Cancer. 2016(12)
[2]miR-206 Inhibits Renal Cell Cancer Growth by Targeting GAK[J]. 卫超,王珅,叶章群,陈志强.  Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences). 2016(06)
[3]Competing endogenous RNA networks and gastric cancer[J]. Lei-Lei Guo,Chun-Hua Song,Peng Wang,Li-Ping Dai,Jian-Ying Zhang,Kai-Juan Wang.  World Journal of Gastroenterology. 2015(41)



本文编号：2916199