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基于高通量蛋白组学的OSAHS发病机制的初步探讨

发布时间:2020-12-29 18:00
  目的:本实验通过高通量蛋白组学筛选出OSAHS患者相比于健康对照组血清中发生变化的生物蛋白因子,然后扩大样本量,评估血清中上调/下调蛋白因子的表达与OSAHS病情严重程度之间的关系,分析其与PSG各参数之间的联系。初步探究OSAHS的发病机制,及其与高血压、脂代谢之间的关系,以期为临床治疗提供指导。方法:第一部分:OSAHS患者血清与对照组血清中蛋白质组学定量分析:选取2018年8月至2018年12月就诊与吉林大学第二医院耳鼻喉科的OSAHS成年男性患者10例,同时选取10例健康成年男性作为对照组。空腹采取外周静脉血,采用高通量蛋白组学定量分析方法,检测OSAHS组相比于对照组血清中变化的生物蛋白分子,计算其上调/下调的比率。从中找出与OSAHS发病可能相关的上调/下调因子。第二部分:血清SOD、CAT表达水平与OSAHS发病的相关性分析:选取2018年12月至2019年11月就诊于吉林大学第二医院耳鼻喉科的OSAHS患者,根据PSG结果,选取33例中重度患者,同时选取在我院体检中心的健康对照组25例。留取空腹外周静脉血血清,采用比色法检测血清中SOD、CAT浓度,用统计学软件SPSS... 

【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】:59 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

基于高通量蛋白组学的OSAHS发病机制的初步探讨


图2.1质谱鉴定到肽段的长度分布??

谱图,覆盖度,质谱,分子量


第.2章OSAHS患者血清及对照詛血清定量蛋白=.膚组学僉析??②蛋S质覆盖度与分子量的关系??如r下图2.2所不,.蛋_的分子量与疆盡獻呈现负相关。.厲为分子量:絞太的??蛋白理论上能够产生更多的酶解肽段,所以达到同样的覆盖率,大蛋每所需要??鉴定到的肽段更多a??100?1??£?90?-??I?8〇?-??^?70?-??I?60?-?〇??|?50?-?°?〇〇?。??|?40?-?〇?〇〇?<x?〇??,齡v。':。。。??£?l〇〇?▲〇&§〇?〇〇?oSoo?o??0?100?200?300?400??Protein?mass?[kDa]??图2.?2质谱鉴定到的蛋白分子量与覆盖度的关系??③质谱仪的质量精度分布??如下图2.3所示,绝大多数谱图的一级质量误差在lOppm以内,符合轨??道阱质谱的高精度特性。表明质谱仪的质量精度正常,不会由于质暈偏差过大??而影响到蛋白的定性定量分析。谱图匹配肽段的得分(表征肽段鉴定的可信度)??与质量偏差的分布成负相关关系。因而得分越高,质量偏差越校??13??

质量图,质谱,蛋白,样本


第2章OSAHS患者血清及对照组血清定量蛋白质组学分析??305?-I??8°〇??1?邊??秦5?_??I?I?I?I?5?I?I?I?I??-20?-15?-10?-5?0?5?10?15?20??Peptide?mass?error?[ppm]??图2.?3质谱数据的质量精度分布??(8)差异表达蛋白的计算??通过三次全蛋&的定:量重复实验,分别得到了每个样本在三次重复中的??定量值。第一步计算比较组中两个样本间蛋白的差异表达量,首先计算出每个??样本在三次重复中定量值的平均值,然后再计算两个样本之间平均值的比值,??该比值作为比较组最终的差异表达量。第=步计算该蛋&在两个样本中的差??异表达显著性P-value,首先将各个样本的相对定量值取log2?(以使得数据符??合正态分布),然后用双样本双尾T检验方法计算p-value。当p-value<0.05??时,以差异表达暈变化超过1.2作为显著上调的变化阈值,小于1/1.2作为显??著下调的变化阈值。??2.3结果??(1)?OSAHS组和对照组之间基本资料分析:两组研宄对象年龄分布大??致相当,未见统计学差异。OSAHS组体重指数BMI高于对照组,P<0.05,差??异有统计孿意义(见表2.4)。??14??

【参考文献】:
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本文编号:2946052

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