基于高通量蛋白组学的OSAHS发病机制的初步探讨
发布时间:2020-12-29 18:00
目的:本实验通过高通量蛋白组学筛选出OSAHS患者相比于健康对照组血清中发生变化的生物蛋白因子,然后扩大样本量,评估血清中上调/下调蛋白因子的表达与OSAHS病情严重程度之间的关系,分析其与PSG各参数之间的联系。初步探究OSAHS的发病机制,及其与高血压、脂代谢之间的关系,以期为临床治疗提供指导。方法:第一部分:OSAHS患者血清与对照组血清中蛋白质组学定量分析:选取2018年8月至2018年12月就诊与吉林大学第二医院耳鼻喉科的OSAHS成年男性患者10例,同时选取10例健康成年男性作为对照组。空腹采取外周静脉血,采用高通量蛋白组学定量分析方法,检测OSAHS组相比于对照组血清中变化的生物蛋白分子,计算其上调/下调的比率。从中找出与OSAHS发病可能相关的上调/下调因子。第二部分:血清SOD、CAT表达水平与OSAHS发病的相关性分析:选取2018年12月至2019年11月就诊于吉林大学第二医院耳鼻喉科的OSAHS患者,根据PSG结果,选取33例中重度患者,同时选取在我院体检中心的健康对照组25例。留取空腹外周静脉血血清,采用比色法检测血清中SOD、CAT浓度,用统计学软件SPSS...
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.1质谱鉴定到肽段的长度分布??
第.2章OSAHS患者血清及对照詛血清定量蛋白=.膚组学僉析??②蛋S质覆盖度与分子量的关系??如r下图2.2所不,.蛋_的分子量与疆盡獻呈现负相关。.厲为分子量:絞太的??蛋白理论上能够产生更多的酶解肽段,所以达到同样的覆盖率,大蛋每所需要??鉴定到的肽段更多a??100?1??£?90?-??I?8〇?-??^?70?-??I?60?-?〇??|?50?-?°?〇〇?。??|?40?-?〇?〇〇?<x?〇??,齡v。':。。。??£?l〇〇?▲〇&§〇?〇〇?oSoo?o??0?100?200?300?400??Protein?mass?[kDa]??图2.?2质谱鉴定到的蛋白分子量与覆盖度的关系??③质谱仪的质量精度分布??如下图2.3所示,绝大多数谱图的一级质量误差在lOppm以内,符合轨??道阱质谱的高精度特性。表明质谱仪的质量精度正常,不会由于质暈偏差过大??而影响到蛋白的定性定量分析。谱图匹配肽段的得分(表征肽段鉴定的可信度)??与质量偏差的分布成负相关关系。因而得分越高,质量偏差越校??13??
第2章OSAHS患者血清及对照组血清定量蛋白质组学分析??305?-I??8°〇??1?邊??秦5?_??I?I?I?I?5?I?I?I?I??-20?-15?-10?-5?0?5?10?15?20??Peptide?mass?error?[ppm]??图2.?3质谱数据的质量精度分布??(8)差异表达蛋白的计算??通过三次全蛋&的定:量重复实验,分别得到了每个样本在三次重复中的??定量值。第一步计算比较组中两个样本间蛋白的差异表达量,首先计算出每个??样本在三次重复中定量值的平均值,然后再计算两个样本之间平均值的比值,??该比值作为比较组最终的差异表达量。第=步计算该蛋&在两个样本中的差??异表达显著性P-value,首先将各个样本的相对定量值取log2?(以使得数据符??合正态分布),然后用双样本双尾T检验方法计算p-value。当p-value<0.05??时,以差异表达暈变化超过1.2作为显著上调的变化阈值,小于1/1.2作为显??著下调的变化阈值。??2.3结果??(1)?OSAHS组和对照组之间基本资料分析:两组研宄对象年龄分布大??致相当,未见统计学差异。OSAHS组体重指数BMI高于对照组,P<0.05,差??异有统计孿意义(见表2.4)。??14??
【参考文献】:
期刊论文
[1]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的诊疗进展[J]. 韦显福. 中外医学研究. 2019(23)
[2]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者自动调节持续气道正压通气治疗前后氧化应激水平的变化[J]. 都勇,丁怡,陈旭如,何炜,施天昀,揭志军. 临床内科杂志. 2019 (07)
[3]持续正压通气和N-乙酰半胱氨酸治疗对中重度OSAHS患者血清氧化应激及炎症水平的影响[J]. 朱建勇,李俊敏,范荣梅,张立波,何敏. 武汉大学学报(医学版). 2019(03)
[4]阻塞性睡眠呼吸暂停与血脂异常的研究进展[J]. 李娟,秦彦文. 心肺血管病杂志. 2018(08)
[5]氧化应激和RAAS系统在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征合并高血压发病机制中的作用[J]. 郭香香,任寿安,韩涌. 世界最新医学信息文摘. 2018(43)
[6]氧化应激与高血压[J]. 施伟丽,袁蓉,信琪琪,金宇,丛伟红,陈可冀. 医学综述. 2018(04)
[7]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征对血糖、血脂及C反应蛋白的影响[J]. 任涛,唐以军,王梅芳,刘岩,钱鑫. 山东大学耳鼻喉眼学报. 2017(06)
[8]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征冠状动脉旁路移植术预后的研究[J]. 高铭鑫,于洋,魏永祥. 心肺血管病杂志. 2017(05)
[9]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征相关性高血压患者血清胱抑素C和超氧化物歧化酶水平的变化[J]. 侯婷婷,周川,谢萍,邓建君,谢宇平,李重伟,苏鹏,张文静,何勤利. 中国循环杂志. 2016(05)
[10]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者血清瘦素和脂联素检测及临床分析[J]. 文娟,张大为,明昊,毛圆,马骏,蒋帅,陈仁杰. 中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志. 2015(02)
本文编号:2946052
【文章来源】:吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:59 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图2.1质谱鉴定到肽段的长度分布??
第.2章OSAHS患者血清及对照詛血清定量蛋白=.膚组学僉析??②蛋S质覆盖度与分子量的关系??如r下图2.2所不,.蛋_的分子量与疆盡獻呈现负相关。.厲为分子量:絞太的??蛋白理论上能够产生更多的酶解肽段,所以达到同样的覆盖率,大蛋每所需要??鉴定到的肽段更多a??100?1??£?90?-??I?8〇?-??^?70?-??I?60?-?〇??|?50?-?°?〇〇?。??|?40?-?〇?〇〇?<x?〇??,齡v。':。。。??£?l〇〇?▲〇&§〇?〇〇?oSoo?o??0?100?200?300?400??Protein?mass?[kDa]??图2.?2质谱鉴定到的蛋白分子量与覆盖度的关系??③质谱仪的质量精度分布??如下图2.3所示,绝大多数谱图的一级质量误差在lOppm以内,符合轨??道阱质谱的高精度特性。表明质谱仪的质量精度正常,不会由于质暈偏差过大??而影响到蛋白的定性定量分析。谱图匹配肽段的得分(表征肽段鉴定的可信度)??与质量偏差的分布成负相关关系。因而得分越高,质量偏差越校??13??
第2章OSAHS患者血清及对照组血清定量蛋白质组学分析??305?-I??8°〇??1?邊??秦5?_??I?I?I?I?5?I?I?I?I??-20?-15?-10?-5?0?5?10?15?20??Peptide?mass?error?[ppm]??图2.?3质谱数据的质量精度分布??(8)差异表达蛋白的计算??通过三次全蛋&的定:量重复实验,分别得到了每个样本在三次重复中的??定量值。第一步计算比较组中两个样本间蛋白的差异表达量,首先计算出每个??样本在三次重复中定量值的平均值,然后再计算两个样本之间平均值的比值,??该比值作为比较组最终的差异表达量。第=步计算该蛋&在两个样本中的差??异表达显著性P-value,首先将各个样本的相对定量值取log2?(以使得数据符??合正态分布),然后用双样本双尾T检验方法计算p-value。当p-value<0.05??时,以差异表达暈变化超过1.2作为显著上调的变化阈值,小于1/1.2作为显??著下调的变化阈值。??2.3结果??(1)?OSAHS组和对照组之间基本资料分析:两组研宄对象年龄分布大??致相当,未见统计学差异。OSAHS组体重指数BMI高于对照组,P<0.05,差??异有统计孿意义(见表2.4)。??14??
【参考文献】:
期刊论文
[1]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征的诊疗进展[J]. 韦显福. 中外医学研究. 2019(23)
[2]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者自动调节持续气道正压通气治疗前后氧化应激水平的变化[J]. 都勇,丁怡,陈旭如,何炜,施天昀,揭志军. 临床内科杂志. 2019 (07)
[3]持续正压通气和N-乙酰半胱氨酸治疗对中重度OSAHS患者血清氧化应激及炎症水平的影响[J]. 朱建勇,李俊敏,范荣梅,张立波,何敏. 武汉大学学报(医学版). 2019(03)
[4]阻塞性睡眠呼吸暂停与血脂异常的研究进展[J]. 李娟,秦彦文. 心肺血管病杂志. 2018(08)
[5]氧化应激和RAAS系统在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征合并高血压发病机制中的作用[J]. 郭香香,任寿安,韩涌. 世界最新医学信息文摘. 2018(43)
[6]氧化应激与高血压[J]. 施伟丽,袁蓉,信琪琪,金宇,丛伟红,陈可冀. 医学综述. 2018(04)
[7]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征对血糖、血脂及C反应蛋白的影响[J]. 任涛,唐以军,王梅芳,刘岩,钱鑫. 山东大学耳鼻喉眼学报. 2017(06)
[8]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征冠状动脉旁路移植术预后的研究[J]. 高铭鑫,于洋,魏永祥. 心肺血管病杂志. 2017(05)
[9]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征相关性高血压患者血清胱抑素C和超氧化物歧化酶水平的变化[J]. 侯婷婷,周川,谢萍,邓建君,谢宇平,李重伟,苏鹏,张文静,何勤利. 中国循环杂志. 2016(05)
[10]阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征患者血清瘦素和脂联素检测及临床分析[J]. 文娟,张大为,明昊,毛圆,马骏,蒋帅,陈仁杰. 中国中西医结合耳鼻咽喉科杂志. 2015(02)
本文编号:2946052
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