RNA测序法比较POAG与非POAG供体眼球小梁网基因表达的差异

发布时间：2021-04-09 05:20

　　目的使用RNA测序技术比较原发性开角型青光眼（POAG）与正常人小梁网组织基因表达谱的差异,探讨POAG可能的基因学病因。方法实验组小梁网组织来自汕头国际眼科中心行小梁切除术的3例POAG患者,对照组小梁网组织来自汕头眼库的2例非POAG供体眼球。提取2个组小梁网组织RNA进行测序获得基因表达谱,用R软件包edgeR分析实验组与对照组基因表达的差异,用DAVID生物信息分析网站对差异基因进行基因本体（GO）及功能注释聚类分析。采用KOBAS 3.0进行PANTHER富集通路分析,揭示POAG可能的基因学病因。结果 （1）RNA测序共得到28 821条基因,2个组间有统计学差异的基因22条[错误发现率（FDR）<0.05],其中转录表达上升的基因1条,转录表达下降的基因21条;（2）表达差异的基因功能集中,生物学过程涉及角化、表皮发育、中间丝细胞骨架组织等,细胞成分涉及角蛋白丝、中间丝、细胞外泌体、触珠蛋白-血红蛋白复合体等,分子功能涉及结构分子活性、细胞骨架结构组成等;（3）与差异基因相关的PANTHER富集通路主要包括纤溶酶原激活级联反应、p38 MAPK、氧化应激反应及p53... 

【文章来源】：中华实验眼科杂志. 2020,38(08)北大核心CSCD

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本文编号：3126997