NPC患者转移相关lncRNAs表达分析

发布时间：2021-12-16 13:56

　　目的发现和鉴定在NPC转移与非转移患者中差异表达的长链非编码RNAs(lncRNAs),并预测它们潜在的生物学功能。方法利用高通量测序技术分别检测2位非转移性NPC患者及3位转移性NPC患者血清中lncRNAs的表达情况,并通过基因本体(GO)及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析并预测lncRNAs潜在的生物学机制。结果与非转移性NPC患者血清比较,转移组中有2条高表达及12条低表达的lncRNAs(P<0.05)。其中在转移组中低表达的lncRNA ENST00000610778差异倍数较大。这些lncRNAs对应的周围编码蛋白质的基因富集于翻译、核糖体大亚基组装、病毒转录等生物学过程及核糖体通路。结论在转移与非转移NPC患者血清中,存在差异表达的lncRNAs,它们可能具有特定的生物学功能,成为转移性NPC诊治的新靶标。

【文章来源】： 安徽医科大学学报. 2020,55(11)北大核心

【文章页数】：5 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 标本收集
    1.2 RNA提取和鉴定
    1.3 文库构建
    1.4 文库质检
    1.5 上机测序
    1.6 测序数据分析和基因功能分析
    1.7 统计学处理
2 结果
    2.1 文库质量评估及测序数据质量控制
    2.2 lncRNAs相应基因的GO分析
    2.3 lncRNAs周围对应mRNAs的KEGG通路分析
3 讨论



本文编号：3538254