LncRNA CASC15:4在鼻咽癌组织中的表达及意义

发布时间：2024-12-07 06:53

　　1.目的:鼻咽癌(Nasopharyngeal carcinoma;NPC)是具有地区性流行趋势的我国常见恶性肿瘤疾病之一,且在耳鼻喉科常见恶性肿瘤疾病中,鼻咽癌的发病率更是高居榜首。鼻咽癌多数发生于鼻咽部顶后壁、侧壁等隐匿部位,侵袭性强而转移早。考虑多数鼻咽癌患者就医时已处于中晚期状态并有远处转移,治疗效果多数欠佳,而早诊断、早治疗能明显改善其预后。因此寻找鼻咽癌的诊治生物标志物而为临床早诊断提供相关依据,将有效改善患者的生存质量。本研究在全转录组高通量测序实验基础上,通过实时荧光定量PCR方法检测lncRNA CASC15:4在鼻咽癌组织中的表达及其与多种临床病理因素特征的相关性,借此发现鼻咽癌诊治过程中的新兴肿瘤标志物,以便为鼻咽癌患者早期诊断提供理论指导依据。2.方法:(1)收集南华大学附属第一医院门诊耳鼻喉科医师行鼻内窥镜下活检术的残余组织样本,获得首诊鼻咽部非癌症组织20例和鼻咽部癌症组织30例。所有的活检组织均由南华大学附属第一医院病理科证实为鼻咽癌组织或鼻咽慢性炎症组织。所有的临床相关信息来自于被检患者填写的信息采集表。(2)选取6例病理结果分别确诊为鼻咽癌及鼻咽炎症的组...

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【部分图文】：

图4.1碱基质量分布图

第4章实验结果4.1鼻咽癌组织和鼻咽部非癌组织样本测序及结果分析4.1.1本实验原始数据质量评估1）本实验原始数据碱基质量评估

图4.2序列质量得分注：横轴为quality，纵轴是reads数目3）比对结果质控

162)本实验原始数据序列质量评估图4.2序列质量得分注：横轴为quality，纵轴是reads数目3)比对结果质控一个高质量的数据rRNA百分比应小于5%，当其大于5%时意味着实验过程中rRNA去除不完全。如果有大于50%的基因间区域的序列数，则意味着基因组序列的污染。本实验原....

图4.3差异表达lncRNA热图

222）组间比较显著性差异表达lncRNA热图利用R软件将样本lncRNA基因进行了聚类，此热图中每一列代表一个样本，每一行代表一个基因，红色示意为趋势上调，绿色示意为趋势下调。图4.3差异表达lncRNA热图

图4.4差异表达lncRNA火山图

233）组间比较显著性差异表达lncRNA火山图火山图清晰的展示了lncRNA的差异表达分布。其中，红色的点示意为趋势上调的lncRNA,绿色的点示意为趋势下调的lncRNA，而蓝色为表达不显著改变。图4.4差异表达lncRNA火山图4.1.4lncRNA顺势调控编码基因的功能富....

本文编号：4014983