新疆地区人群乙型肝炎病毒基因型的初步研究

发布时间：2020-08-01 20:11

【摘要】： 目的:在乙型肝炎病毒的分子流行病学、基础医学和临床治疗的研究中,基因分型技术作为一种重要的研究手段,受到越来越多的重视。乙型肝炎病毒不同基因型的核苷酸的差异可以作为乙型肝炎病毒的传播途径、传染源,流行情况的研究依据。本研究利用序列测定及进化树的绘制的分析方法初步确定了新疆地区乙型肝炎病毒的基因型和血清亚型,S基因变异以及基因型与临床表现之间的关系。方法:在新疆维吾尔自治区人民医院体检中心、门诊和病房采集血清,利用双抗体夹心ELISA筛查HBsAg阳性血清,提取核酸并进行PCR扩增,获得HBV S基因序列。利用ATGC及DNASTAR软件将样本HBV S基因的测序结果与GeneBank中的25株HBV参考株进行核苷酸同源性比对,初步确定新疆地区乙型肝炎病毒的基因型,绘制系统发生树,并且由核苷酸序列推导出氨基酸序列,由此确定乙型肝炎病毒血清亚型以及S基因的变异情况。结果:(1)新疆地区乙型肝炎病毒基因型以C基因型居多,D基因型其次,此外还有少数B基因型。(2)新疆地区乙型肝炎病毒的血清亚型多数为ayw型,少数为adr型。(3)HBV S基因序列每100个nt突变的频数为2.17。在S基因的两个关键位点发现了有意义的a.a.突变:Q129H和M133L,两个位点都位于α抗原决定簇的第一个茎环结构内。(4)乙型肝炎病毒患者各种临床表现均以C基因型感染为主,肝硬化及肝癌患者中大部分为C基因型和D基因型,B、C、D三种基因型在乙型肝炎病毒携带者中均有分布,在慢性肝炎患者中,B基因型比例较大。结论:本研究初步确定了新疆地区的乙型肝炎病毒的基因型和血清亚型,基因变异以及基因型与临床表现的基本关系情况,为制定针对新疆地区的乙型肝炎预防控制策略和指导临床治疗提供了一定的参考依据。
【学位授予单位】：新疆农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2010
【分类号】：R512.62
【图文】：

模拟图,模拟图,基因组,基因启动子

因比野生型 X 基因具有更强的反式激活作用。HbxAg 与 P53 可以结合，从而使细胞生长失控。组中还有一些调控元件，包括 4 个不同的启动子及 2 个增19-2780）和 SP（2nt2509-3152）分别调控转录 2.4kb mRNA蛋白，后者编码中蛋白或主蛋白。C 基因启动子 CP（键调节因子，指导 3.4kb 前基因组 mRNA 和 3.5kb 前 C nt1742-1849）和上游调控序列（nt1643-1742）两部分构作用。X 基因启动子 XP（nt1235-1374）调节转录 0.8k种增强子皆位于 ORF 中，十分保守，其中 EnhⅠ(nt974-，能够明显促进 SP1、SP2、C 和 X 启动子所启动的所有627-1774）位于 X 基因中，末端含 CP，能激活全长基因[2]。

PCR扩增,三甲医院,流行情况,碱基置换

（Lys/Arg 为 w/r 抗原决定簇），将各样本分为不同的血清型。 DNASTAR 软件中的 MegAlign 工具里的 Clustal W 对测序结果和 C对，将碱基置换和氨基酸突变点进行统计，对样本 HBV S 基因突变分析，计算 S 基因突变的频率。结果V S 基因的扩增、序列测定及分析验通过核酸提取和巢式 PCR 扩增，获得新疆地区 254 份 HBV S 基因疆维吾尔自治区人民医院是一所三甲医院，其患者来自全疆各地，因在一定程度上能代表新疆 HBV 基因型的流行情况。BV S 基因的 PCR 扩增式PCR方法扩增出了与预期大小相同，约700bp的HBV S基因片段（

【参考文献】