探究结肠息肉患者潜在的肠道菌群标志物

发布时间：2024-10-03 03:26

　　结直肠癌在全球恶性肿瘤发病率中排第三名,有至少80%的结直肠癌由结肠息肉演变而来。结肠镜是诊断结肠息肉的金标准,但费用高,操作繁琐,患者接受度差,容易延误诊疗时机。因此,探究简便有效的结肠息肉筛查方法对结直肠癌早诊早治具有重要意义。新一代测序技术发现,肠道微生态与人类的健康和疾病息息相关,结肠腺瘤患者的肠道微生物群落结构和多样性均发生改变。本课题首先利用细菌16s rDNA和真菌ITS2高通量测序技术,通过R语言分析方法探讨结肠息肉患者肠道内微生物群落结构,结果表明与健康人群对比,息肉患者肠道微生物群落结构发生明显改变,即细菌、真菌的菌群多样性下降,并且在不同分类水平上均发现了表达丰度显著差异的菌落;其次,结合Lefse分析手段表明,息肉患者具有相对丰度较高的致病性细菌(如拟杆菌属、副杆菌属、梭杆菌属等)和机会致病性真菌(如念珠菌属、曲霉菌属等);此外,进一步探究不同病理类型和息肉数目的患者肠道微生物群落结构的差异,发现多样性和丰富度均无明显改变;最后,构建以上差异菌检验模型,利用ROC曲线分析检验结肠息肉的敏感性和特异性,得到曲线下面积达0.7以上。综上所述,本课题探讨了息肉患者肠道内...

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３．１各样品细菌群落测序深度情况

１．２数据分析??１．２．１结肠息肉组和健康对照组样品测序深度分析??本次研宄绘制了结息肉组和健康对照组所有样本的稀释曲线（图３．１）。两组间各样??本的稀释曲线在５０００左右时出现拐点，后随着测序深度的增加，曲线趋于平缓，至??２００００左右到达平台期。说明各样本的测序数据量合....

图３．２（Ａ）结肠息肉组和健康对照组间肠道内细菌群落ＡＮＯＳＩＭ相似性分析；（Ｂ）结肠息肉??—

品内的微生物群落的丰富度（ＡＣＥ指数、Ｃｈａｏｌ指数、Ｏｂｓｅｒｖｅｄ?ｓｐｅｃｉｅｓ指数）、多样性??（Ｓｈａｎｎｏｎ指数和Ｓｉｍｐｓｏｎ指数）以及均勾度（Ｊ指数），结肠息肉组和健康对照组样品具??体的ｃｔ一多样性参数比较见表４，并绘制成图（图３．２Ｂ）。结果显示，结肠息肉组和....

图３．３结肠息肉组和健康对照组样品细菌群落Ｐ＿多样性分析

道相关细菌群落组成具有显著的差异性，那么在众多的菌群种类里面，有哪些是结肠息??肉组所独有的呢？于是，我们利用已获得的两组各样品的ＯＴＵ数目进行统计，粗略比较??两组间ＯＴＵ分布情况，以此反映两组样品间ＯＴＵ组成情况（图３．４Ｂ）。从两组间的??ＯＴＵ分布Ｖｅｎｎ图可知，肠道相关....

图３．４（Ａ）结肠息肉组和健康对照组样品细菌群落ＮＭＤＳ分析；（Ｂ）结肠息肉组和健康对照??

基于以上的分析结果，我们进一步探究结肠息肉组和健康对照组间的细菌群落分布??情况。首先，我们对结肠息肉组和健康对照组所有样品数据进行细菌群落门水平构成情??况分析。如图３．５所示，结肠息肉组和健康对照间每个样品的肠道粪便相关细菌群落组成??结构是不同的。总体看来，结肠息肉组的厚壁....

本文编号：4006697