动脉粥样硬化易感基因挖掘与生物信息学分析

发布时间：2018-07-03 13:08

  本文选题：动脉粥样硬化 + 易感基因　； 参考：《中国老年学杂志》2017年24期

【摘要】：目的挖掘动脉粥样硬化(AS)易感基因,为寻找AS正确的诊断和治疗方法提供线索和数据支撑。方法从Pub Med、OMIM和GEO数据库检索AS相关数据,利用SMD在线工具对AS易感基因进行染色体定位,并通过DAVID和STRING10.0软件进行基因功能注释和蛋白互作分析。结果共获得AS易感基因454个,其染色体定位分布不均匀,以1、11、2和4号分布较多,Y染色体多于X染色体上的分布;AS易感基因富集在24个生物学功能注释单元中,其中44个编码蛋白存在互作关系,涉及多种生物学过程和分子功能。结论 AS易感基因的控掘与生物信息分析为AS的分子水平机制研究提供了数据平台,为多基因复杂疾病的基因挖掘提供了有效方法。
[Abstract]:Objective to explore the susceptibility gene of atherosclerosis (as) and to provide clues and data support for the correct diagnosis and treatment of as. Methods the AS-related data were retrieved from the database of Pub MedOMIM and GEO, and chromosomal mapping of as susceptibility genes was carried out by using SMD online tool, and gene function annotation and protein interaction analysis were carried out by DAVID and STRING10.0 software. Results A total of 454 AS-susceptible genes were obtained, and their chromosomal location was not uniform. The distribution of AS-susceptible genes on chromosome 1, 11, 2 and 4 was more than that on chromosome X, and was concentrated in 24 biological function annotation units. Among them, 44 encoded proteins are interacted, involving many biological processes and molecular functions. Conclusion the analysis of as susceptibility genes and biological information provides a data platform for the study of molecular mechanism of as and an effective method for gene mining of polygenic complex diseases.
【作者单位】： 河北北方学院医学检验学院生物化学教研室;河北北方学院基础医学院医学影像学系;
【分类号】：R543.5

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本文编号：2093755