基于调控网络分析筛选急性冠状动脉综合征的miRNA标志物

发布时间：2017-08-30 02:27

  本文关键词：基于调控网络分析筛选急性冠状动脉综合征的miRNA标志物

  更多相关文章： 急性冠脉综合征 急性心肌梗死 不稳定型心绞痛 mi RNA 生物标志物 富集分析

【摘要】：急性冠状动脉综合征(ACS)是一个高发病率、高死亡率的疾病,该病主要分为两个亚型:急性心肌梗死(AMI)和不稳定型心绞痛(UA)。临床上,很多患者会由于诊断的不及时或者诊断的依据不全面而错过了宝贵治疗时间。Micro RNA(mi RNA)是在真核生物中广泛存在的非编码RNA,通过碱基互补配对原则与目标信使核糖核酸(m RNA)结合,调控基因表达,是理想的生物标志物。本课题基于mi RNA-m RNA调控网络筛选ACS两个亚型相关的潜在mi RNA标志物。从GEO数据库中分别收集与两个亚型相关的mi RNA表达数据,将具有差异表达现象的mi RNA映射到已构建的mi RNA-m RNA调控网络中。重点关注每个具有差异表达现象的mi RNA在网络中独立调控基因的能力并使用新的出度指标NOD量化表示。最终在AMI和UA中分别找到了27个和26个潜在的mi RNA生物标志物,其中8个mi RNA是两亚型共有的,每种亚型中分别有5个在文献中被报道。通过对结果mi RNA的靶基因进行富集分析,在AMI和UA中分别找到35条和18条相关的信号通路。通过文献验证,在AMI中发现其中的28条通路是已被报道与疾病相关的。在UA富集的结果中,也找到了12条已被报道和疾病相关的通路。本课题基于创新的理论筛选了ACS两个亚型的潜在mi RNA生物标志物并比较了它们的异同。在此基础上,更深层次地分析了两种亚型mi RNA靶基因所富集的生物信号通路。对于该病的临床诊断和治疗具有重要的指导意义。
【关键词】：急性冠脉综合征 急性心肌梗死 不稳定型心绞痛 mi RNA 生物标志物 富集分析
【学位授予单位】：苏州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R541.4;R440
【目录】：

• 中文摘要4-5
• Abstract5-8
• 第1章 引言8-12
• 1.1 课题研究背景8-10
• 1.1.1 急性冠状动脉综合症研究现状、背景及其意义8-10
• 1.1.2 研究miRNA作为生物标志物和其网络特征的意义10
• 1.2 本文的研究结构和目的10-12
• 第2章 网络的构建及其筛选指标12-13
• 2.1 miRNA-mRNA调控网络的构建12
• 2.2 NOD(novel out degree)值的定义和作用12-13
• 第3章 数据收集和数据筛选13-16
• 3.1 数据收集13
• 3.2 差异miRNA筛选方法13-14
• 3.3 亚型中miRNA生物标志物的筛选结果14-16
• 第4章 miRNA层次的分析与验证16-22
• 4.1 文献报道的亚型miRNA生物标志物16-21
• 4.2 亚型数据验证21-22
• 4.2.1 AMI的验证21
• 4.2.2 UA的验证21-22
• 第5章 生物信号通路层次的分析与验证22-41
• 5.1 亚型的信号通路富集22-29
• 5.1.1 AMI富集通路的概括和分类22-23
• 5.1.2 AMI文献报道的通路23-26
• 5.1.3 UA富集通路的概括和分类26-27
• 5.1.4 UA文献报道通路27-29
• 5.2 亚型中明确报道的独有通路29-35
• 5.2.1 AMI独有通路29-34
• 5.2.2 UA独有通路34-35
• 5.3 亚型中明确报道的共有通路35-41
• 5.3.1 Development_VEGF signaling and activation35-37
• 5.3.2 Development_PEDF signaling and activation37-38
• 5.3.3 NF-kB因子相关的通路38-39
• 5.3.4 多发性神经纤维瘤病Ⅰ型通路39-41
• 第6章 结论与展望41-42
• 参考文献42-55
• 附录一55-68
• 攻读硕士学位期间公开发表的论文68-69
• 致谢69-70

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