5、6号染色体上SNP位点与高度近视的关联研究

发布时间：2020-10-10 09:58

　　 目的本实验拟研究5、6号染色体上位点(rs575425, rs492842, rs7706272, rs6895664, rs10484791和rs2073135)的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP),研究其与中国汉族人群高度近视的关联性。 方法通过全基因组扫描选取5、6号染色体上的6个阳性SNPs (rs575425, rs492842, rs7706272, rs6895664, rs10484791和rs2073135)。选择506例高度近视患者和991例正常健康者(均为中国汉族),收集其外周血标本并提取标本DNA。根据上述6个位点相应序列设计上、下游扩增引物和SNaPshot引物,用聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR)进行DNA扩增,用不同荧光标记的ddNTP对PCR产物进行一步延伸,然后置于310型DNA测序仪上检测基因型,即SNaPshot技术。对检测的结果进行Hardy—Weinberg平衡检验、卡方检验、连锁不平衡分析及单倍体分析,判断6个SNPs与高度近视易感性之间的关系。 结果6个SNP位点的基因型都符合Hardy-Weinberg平衡(P0.05)。rs10484791和rs2073135位点的等位基因频率和基因型频率在高度近视组和对照组间差别有统计学意义(P0.05). rs575425, rs492842, rs7706272和rs6895664位点等位基因频率和基因型频率在高度近视组和对照组间差异没有统计学意义(PO.05)。rs10484791和rs2073135都位于脑组织特异性血管生成抑制因子3(brain-specific angiogenesis inhibitor-3, BAI3)基因区域,且位于连锁不平衡区域。单倍体型H1 (CG)和单倍体型H2(TA)在高度近视组和对照组间差异有统计学意义(P0.05)。 结论BAI3基因的rs10484791和rs2073135位点与中国汉族人群高度近视相关。
【学位单位】：青岛大学
【学位级别】：硕士
【学位年份】：2011
【中图分类】：R778.11
【部分图文】：

7龙T417(21.04)C1565(78.96)7-/CT671(33.85)C1311(66.15)A/GA667(33.65)G1315(66.35)域的两个sNps的单倍型频率分布的rsl0484791和rs2073135位点同析，这两个位点之间存在连锁不平isequilibriumbloek，LDblock)，进种单倍型中有3个单倍型的频率大于G)在高度近视组中频率为57.4%，Z=11.02;P二0.00091);单倍体型(频率为30.5%，也是显著不同(x

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本文编号：2835040