ERAP1、ERAP2、RUNX3基因多态性与强直性脊柱炎和急性前葡萄膜炎遗传易感性的研究
发布时间:2020-12-18 07:43
背景:急性前葡萄膜炎(acute anterior uveitis,AAU)常见的两种形式为特发性急性前葡萄膜炎(Idiopathic acute anterior uveitis,IAAU)和强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)伴发的急性前葡萄膜炎(AS+AAU+)。随着AS病程的延长,AAU的病发率出现持续增加。全基因组关联分析(genome-wide association study,GWAS)研究显示ERAP1、ERAP2和RUNX3基因多态性与欧洲高加索人的AS及AAU易感性相关,而且ERAP1和HLA-B27的联合风险在人群中高达70%。RUNX3和ERAP1、ERAP2在T细胞的发育、分化和功能中发挥着重要的作用,AS和AAU均被认为是由T细胞介导的自身免疫性疾病。国际上关于ERAP1基因对AS的易感性研究较为深入。然而,关于ERAP1、ERAP2和RUNX3基因多态性与中国汉族人的AAU和AS的相关性研究很少而且结果并不一致。目的:本项研究目的在于通过大样本再次评估ERAP1、ERAP2和RUNX3 单核苷酸多态性(Single nucl...
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:116 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型质控?红色表示质谱仪无法识别的样本,绿色代表??能够识别的样本,颜色越深表示识别率越高
rs7551188、rs9438876)。本实验采用了大样本来验证这些位点与中国汉族人AS的??患病分险的关联性。实验所选定的17个SNP均成功分型。17个SNP总体质量控??制结果如图1.1。单个SNP质谱法分型结果均良好,以rs30187位点的基因分型为??例见图1.2。??1丨2:3|4|5|6|7丨8|9.?|10丨11|12|13|14|15|16丨17|18丨19丨船1?22:23丨24??籲??????????????參?????????參???參參參????????????C???????????攀參肇?參??參????D?????????肇參?參⑩???????????????????????參參???¥參參?■???參肇?.!?????I?參??參???⑩?????????#■?????丄??????參??籲?參參??????參??\?參拳??拳攀參_??????參參_??拳??丄?參?參?⑩肇???■?參???M??????參?肇??肇參????_?????????參?參??肇?J?參《???0??????⑩??參■籲镰參??肇??上|蟓《**?##參》???攀參參???》_??參???图1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型质控?红色表示质谱仪无法识别的样本,绿色代表??能够识别的样本,颜色越深表示识别率越高。??Figl.l?Quality?control?of?Sequnom?Mass?ARRAY?SNP.?Red?indicates?sample?that?cannot?be??recognized
基因较近的连锁现象。这是发现致病基因的一种手段。本次实验我们分析了??ERAP1、ERAP2基因区及附近11个SNP位点,因此,进一步分析了这11个位点??可能的单倍型及可能的致病性的单倍型。图1.3显示了?11个SNP位点中有多个基??因位点存在完全连锁现象(rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434,??rs2549782/2248374?),也即形成了?rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434?和??rs2549782/2248374三个单倍型。单倍型分析我们采用HaploView4.2软件进行分析。??结果显示未发现有单倍型与AS的疾病易感性相关联,结果见表1.5。??.卜?O?(M?1?S??S?ft?Si?°?ts?°?m?S?S3?53????xwwmvtmtfixxwm??I?Block?1?(3?kb)?|?日lock?2?t5?kb)?I?Block?3?(4?kb)??L?1?8?11?J?51?77?93?L?127?158?丄?682?720?J?1121??i?65?▼?59?B8?7EI?▼??67?^?73?59?79??▼?靄、B???2s?'?73??;v:?50?29?83??51?50??^?65?51?60??65?:_6:2.??74??图1.3ERAP1、ERAP2基因位置示意图。强烈的连锁不平衡(rs27037/rs27980/rs27S82,??33??
本文编号:2923637
【文章来源】:重庆医科大学重庆市
【文章页数】:116 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
图1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型质控?红色表示质谱仪无法识别的样本,绿色代表??能够识别的样本,颜色越深表示识别率越高
rs7551188、rs9438876)。本实验采用了大样本来验证这些位点与中国汉族人AS的??患病分险的关联性。实验所选定的17个SNP均成功分型。17个SNP总体质量控??制结果如图1.1。单个SNP质谱法分型结果均良好,以rs30187位点的基因分型为??例见图1.2。??1丨2:3|4|5|6|7丨8|9.?|10丨11|12|13|14|15|16丨17|18丨19丨船1?22:23丨24??籲??????????????參?????????參???參參參????????????C???????????攀參肇?參??參????D?????????肇參?參⑩???????????????????????參參???¥參參?■???參肇?.!?????I?參??參???⑩?????????#■?????丄??????參??籲?參參??????參??\?參拳??拳攀參_??????參參_??拳??丄?參?參?⑩肇???■?參???M??????參?肇??肇參????_?????????參?參??肇?J?參《???0??????⑩??參■籲镰參??肇??上|蟓《**?##參》???攀參參???》_??參???图1.1?Sequenom?Mass?ARRAY?SNP分型质控?红色表示质谱仪无法识别的样本,绿色代表??能够识别的样本,颜色越深表示识别率越高。??Figl.l?Quality?control?of?Sequnom?Mass?ARRAY?SNP.?Red?indicates?sample?that?cannot?be??recognized
基因较近的连锁现象。这是发现致病基因的一种手段。本次实验我们分析了??ERAP1、ERAP2基因区及附近11个SNP位点,因此,进一步分析了这11个位点??可能的单倍型及可能的致病性的单倍型。图1.3显示了?11个SNP位点中有多个基??因位点存在完全连锁现象(rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434,??rs2549782/2248374?),也即形成了?rs27037/rs27980/rs27582,rs30187/rs27434?和??rs2549782/2248374三个单倍型。单倍型分析我们采用HaploView4.2软件进行分析。??结果显示未发现有单倍型与AS的疾病易感性相关联,结果见表1.5。??.卜?O?(M?1?S??S?ft?Si?°?ts?°?m?S?S3?53????xwwmvtmtfixxwm??I?Block?1?(3?kb)?|?日lock?2?t5?kb)?I?Block?3?(4?kb)??L?1?8?11?J?51?77?93?L?127?158?丄?682?720?J?1121??i?65?▼?59?B8?7EI?▼??67?^?73?59?79??▼?靄、B???2s?'?73??;v:?50?29?83??51?50??^?65?51?60??65?:_6:2.??74??图1.3ERAP1、ERAP2基因位置示意图。强烈的连锁不平衡(rs27037/rs27980/rs27S82,??33??
本文编号:2923637
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