鼻咽癌差异表达基因的生物信息学分析及Mad1/c-Myc/P53轴的调控机制研究

发布时间：2024-06-01 11:30

　　鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma,NPC)是一种起源于鼻咽上皮细胞的恶性肿瘤,其恶性程度较高,具有极强的转移能力。早期鼻咽癌患者的症状往往缺乏或非特异性,显著降低了诊断和预测鼻咽癌发展的准确性,临床NPC经常在晚期诊断,诊断后存活率相对较低。因此,研究鼻咽癌发病发展的分子机制,寻找用于鼻咽癌早期诊断、个体化治疗及预后评估的分子标记物有着极其重要的的临床指导意义。近年来,用于分析基因表达的高通量平台,如微阵列技术,广泛用于获取肿瘤发生过程中的主要遗传突变。根据文献报道,鼻咽癌的许多基因表达分析涉及微阵列技术,并鉴定了许多差异表达基因的信号通路,分子功能或生物过程。然而,比较分析表明独立研究中的DEGs(Differentially expressed genes)几乎没有重叠,从正常组织中没有确定鼻咽癌组织的可靠生物标志物。尽管取得了这样的进展,相互作用网络中的DEGs与信号通路的相互作用机制仍不清楚。因此,利用大数据生物信息学分析方法,挖掘和整合数据,获取鼻咽癌相关的差异表达基因和信号通路,预测主要生物标记物来促进鼻咽癌的早期诊断和治疗,具有重要的现实意义。生物...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图1-1DAVID6.8分析界面

?第一章前言???相互作用网络的的改变可能明确调整了疾病相关途径，基于此，在药物发现研??宄中，能够突破传统的基于单个靶蛋白的简单抑制和激活功能的药物筛选方??式，提供了药物发现的新途径。因此，蛋白质相互作用网络在分子生物学研宄??中具有极为重要的作用。??１１

图２－２?ＧＥ０２Ｒ的分析界面图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－２?Ａｎａｌｙｓｉｓ?ｉｎｔｅｒｆａｃｅ?ｏｆ?ＧＥ０２Ｒ??

具体分析步骤如下：??登陆ＤＡＶＩＤ网站首页ｒｈｔｔｐｓ：／／ｄａｖｉｄ．ｎｃｉｆｃｒｆ．ｇｏｖＡ），点击页面左上角??“Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?Ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ＇１功能选项进入功能注解工具界面，如图２－３所７Ｋ。通过??页面左侧蓝色面板区域“ｕｐｌｏａｄ”上传基因列表，并按照....

图2-3FunctionalAnnotation工具分析界面

?第二章鼻咽癌相关差异表达基因的生物信息学技术分析???Ｓｔｅｐ?４：?Ｓｕｂｍｉｔ?Ｌｉｓｔ，提交列表，页面会从“Ｕｐｌｏａｄ”自动跳到“Ｌｉｓｔ”面板。用??户可以看到基因的物种以及对应的基因数，此外，还可以管理列表进行应用、??重命名、删除、合并列表、显示基因列表等操作。选....

图２－８ＧＳＥ１２４５２和ＧＳＥ１３５９７?（１００个上调基因和１００个下调基因）前２００个差异表达基??因的热图

６?、、…??图２－７鼻咽癌差异表达基因的蛋白互作网络图??Ｆｉｇｕｒｅ?２－７?Ｐｒｏｔｅｉｎ?Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｎｇ?Ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?Ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｌｌｙ?Ｅｘｐｒｅｓｓｅｄ?Ｇｅｎｅｓ?ｉｎ?ＮＰＣ??（４）下载差异表达基因的蛋白互作网络图中的蛋白质节点列表，....

本文编号：3985827