2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析
发布时间:2017-08-16 18:31
本文关键词:2010年江西省急性出血性结膜炎病原体鉴定及基因进化分析
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【摘要】:为鉴定引起2010年江西省急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic conjunctivitis,AHC)疫情的病原体,并对其进行基因进化分析,本研究采集了20份门诊AHC患者眼结膜拭子,对其进行病毒分离,随后通过逆转录-聚合酶链式反应(Reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)方法分别检测阳性分离物中肠道病毒70型(Human enterovirus type 70,EV70)、柯萨奇病毒A24变异株(Coxsackievirus A24variant,CV-A24v)和腺病毒。并对CV-A24v分离株进行VP1区和3C区全序列测定,分析其与全球流行CV-A24v的基因进化关系。20份标本中有10份病毒分离阳性,PCR检测证明引起本次AHC流行的病原体为CV-A24v。基于3C区构建的基因进化树表明10株江西CV-A24v与全球2010年后分离到的其它CV-A24v同属于GenotypeⅣ基因型的Cluster 5群(GⅣ-C5),而且在GⅣ-C5内江西CV-A24v又分属于A和B两个传播链。基于VP1区构建的基因进化树将全球2000年后分离到的CV-A24v分成5组Group1~5(G1~5),江西CV-A24v属于G5,这些毒株在VP1区进化树中同样分属于A和B两个传播链。本研究表明2010年至少有两个CV-A24v传播链在江西同时流行。VP1区基因进化树对全球2000年后分离到的CV-A24v的组群划分与3C区基本一致,而且与3C区呈现同样显著的年代聚集性。
【作者单位】: 中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所卫生部医学病毒学和病毒病重点实验室世界卫生组织西太平洋区脊髓灰质炎参比实验室;江西省疾病预防控制中心;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所;
【关键词】: 柯萨奇病毒A变异株 急性出血性结膜炎 基因进化分析
【基金】:国家自然科学基金(项目批准号81373049)
【分类号】:R777.31
【正文快照】: 急性出血性结膜炎(Acute hemorrhagic con-junctivitis,AHC)是一种传染性极强的急性病毒性眼病,引起AHC暴发的常见病原体为肠道病毒70型(Human enterovirus 70,EV70)、柯萨奇病毒A24变异株(Coxsackievirus A24variant,CV-A24v)和腺病毒。1969年AHC首次在西非加纳暴发流行,此次
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1 黄吉城;钟玉清;师永霞;刘丽珊;丁国允;郑夔;李小波;苏锦坤;幸芦琴;洪烨;;输入性甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因变异分析[J];中国国境卫生检疫杂志;2014年02期
2 ;[J];;年期
,本文编号:684857
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