基于药效团模型及虚拟筛选方法发现EphB4全新抑制剂
发布时间:2017-11-17 06:23
本文关键词:基于药效团模型及虚拟筛选方法发现EphB4全新抑制剂
更多相关文章: EphB D-QSAR模型 虚拟筛选 分子对接 Catalyst/HypoGen算法 肿瘤靶标
【摘要】:采用计算机模拟手段,通过建立3D-QSAR模型、虚拟筛选及分子对接方法发现恶性肿瘤治疗靶标EphB4潜在的抑制剂。首先,通过Catalyst/HypoGen算法建立药效团模型。其中最好的模型Hypo1具有最高的科雷尔值(Correl值):0.96,最低的RMS值:0.89,与固定消耗值(fixed cost):89.20最接近的总消耗值(total cost):101.26,和最高的Δ消耗值(Δcost值):89.14。随后,Hypo1经过测试集验证及Fischer随机验证,并用于筛选化合物数据库。然后利用类药性筛选及分子对接手段进一步减少分子数量。最终,根据预测活性分析、对接得分值及结合模式分析,得到23个具有全新骨架的化合物作为Eph B4的潜在抑制剂可用于后续研究。
【作者单位】: 四川大学生命科学学院;四川大学化学工程学院;
【基金】:四川省科技支撑计划资助项目(No.2011SZ0116)~~
【分类号】:R91
【正文快照】: 引用本文邵鑫,衣倩颖,杨春蕾.基于药效团模型及虚拟筛选方法发现Eph B4全新抑制剂[J].中国药科大学学报,2016,47(1):38-47.Cite this article as:SHAO Xin,YI Qianying,YANG Chunlei.Discovery of novel Eph B4 inhibitors based on pharmacophore modeling and virtualscreen
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本文编号:1195112
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