计算机辅助limk1抑制剂的开发

发布时间：2017-11-19 07:37

  本文关键词：计算机辅助limk1抑制剂的开发

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【摘要】：limkl是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,主要在细胞质中对含肌动蛋白细胞骨架的组装起作用。当它受激活后可以使丝切蛋白磷酸化,逆转丝切蛋白诱导的肌动蛋白解聚从而促进细胞的大量增长。本论文主要运用3D-QSAR、分子对接、分子动力学模拟和结合自由能计算等方法对limkl抑制剂进行研究以期得到指导化合物设计的信息。在对尿素骨架的limkl抑制剂研究中,我们把抑制剂划分为5个区域并总结出这两个模型的构效关系。在对接中形成很多作用力且残基为Ala353、Glu414、Ile416、His464、Asn465和Leu467,并进行了5ns的动力学验证。根据以上指导信息设计5个尿素骨架衍生物并进行了合成和生测,最终数据表明这5个化合物的活性和选择性都很好。在研究氟原子的引入对limkl抑制剂活性影响时,4个复合物的动力学模拟RMSD值均在3A左右,体系稳定性较好。对复合物RMSF分析,氟原子与残基Gly346之间的作用力及氨基酸残基的波动对活性很重要。通过自由能计算可知静电力和范德瓦尔斯力对limkl抑制剂的活性非常重要。
【学位授予单位】：上海应用技术大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R91

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本文编号：1202815