基于种群密集度的GEP算法挖掘药物不良反应

发布时间：2018-01-18 06:10

本文关键词：基于种群密集度的GEP算法挖掘药物不良反应　出处：《计算机应用研究》2015年10期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：已有的药品安全性评价方法需要知道各参数之间的联系,且过程复杂,或者人为选择统计模型。针对这种情况,提出了药物不良反应(ADR)监测的新方法——基于种群密集度的基因表达式编程算法。该算法在进化中适时计算种群密集度,以判断种群多样性。如果出现搜索迟钝,自动对种群进行新陈代谢,引入新个体;同时算法自动进化ADR人数公式所需的常数,构造ADR人数公式。与标准GEP算法相比,实验表明新方法简单有效,平均进化代数减少约10.8%,平均最高适应度提高约5%。
[Abstract]:Existing drug safety evaluation methods need to know the relationship between the parameters, and the process is complex, or artificially select the statistical model. A new method of ADR-based genetic expression programming based on population density is proposed, which calculates population density in evolution. In order to judge the diversity of the population, if the search is slow, the population can be metabolized automatically and a new individual will be introduced. At the same time, the algorithm automatically evolves the constant required for the ADR number formula and constructs the ADR number formula. Compared with the standard GEP algorithm, the experiment shows that the new method is simple and effective, and the average evolutionary algebra is reduced by about 10.8%. The average maximum fitness increased about 5%.
【作者单位】：西南民族大学计算机科学与技术学院;西南财经大学信息工程学院;四川大学华西医院;
【基金】：国家自然科学基金面上项目(61379019) 四川省学术和技术带头人培养资金重点资助项目西南民族大学中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(2014NZYQN27)
【分类号】：R96;TP311.1
【正文快照】： 0引言现代药品治疗学的发展,不仅要治疗好疾病,而且要防止发生可能或潜在的药物不良反应(adverse drug reaction,ADR)。要合理、安全、有效地用药,必须明确认识某药可能发生的ADR谱。由于新药临床前各种因素的制约,对其ADR谱的认识非常局限,必须通过药品的上市后监测(post-mar

【参考文献】