I50V变异对HIV-1蛋白酶抑制剂Amprenavir抗药机制的分子动力学研究

发布时间：2018-05-12 22:29

  本文选题：HIV-蛋白酶 + 溶解相互作用能方法　； 参考：《原子与分子物理学报》2017年01期

【摘要】：HIV-1蛋白酶PR(HIV-1 protease)的变异对抑制剂产生抗药性,严重消弱抗艾滋病的治疗效果.I50V变异是HIV-1蛋白酶残基变异中最重要的一个.采用分子动力学模拟和溶解相互作用能方法SIE(solvated interaction energy)研究I50V变异对抑制剂APV(amprenavir)抗药机制.分子动力学分析表明I50V变异诱导HIV-1蛋白酶整体柔性的增加,影响了抑制剂与蛋白酶的相互作用.结合自由能计算表明范德华作用的下降驱动了I50V变异对APV的抗药性.基于残基的能量分解证明V50/V50'与APV的相互作用相对于野生型的I50/I50'明显减弱,诱导了抗药性.本研究能为高效的缓解抗药性抑制剂的研发提供一定的理论指导.
[Abstract]:The mutation of HIV-1 protease PR(HIV-1 is one of the most important mutations of HIV-1 protease residues. Molecular dynamics simulation and SIE(solvated interaction energy method were used to study the resistance mechanism of I50V mutation to APV amprenavirl. Molecular dynamics analysis showed that I50V variation induced the increase of overall flexibility of HIV-1 protease and affected the interaction between inhibitor and protease. The combined free energy calculation showed that the decrease of van der Waals effect drove the resistance of I50V mutation to APV. The energy decomposition based on residue showed that the interaction between V50 / V50 'and APV was weaker than that of wild type I50', which induced drug resistance. This study can provide some theoretical guidance for the research and development of high-efficiency drug-resistant inhibitors.
【作者单位】： 山东交通学院理学院;
【基金】：国家自然科学基金(11504206,11274206) 山东省高等学校科技计划项目(J14LJ07)
【分类号】：R96

【参考文献】

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【共引文献】

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【二级参考文献】

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本文编号：1880406