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类黄酮抑制P糖蛋白的三维定量构效关系与作用模式

发布时间:2018-07-09 19:08

  本文选题:类黄酮 + P糖蛋白 ; 参考:《高等学校化学学报》2017年01期


【摘要】:采用基于R基团搜索技术的Topomer CoMFA建立了30个类黄酮类P糖蛋白抑制剂的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型,并用包括9个样本的测试集验证模型的外部预测能力.所得模型的拟合、交互验证以及外部验证的复相关系数分别为r~2=0.971,q~2=0.728和r~2_(pred)=0.816.在此基础上,运用Surflex-dock分子对接法研究了白杨素及其异戊烯化衍生物与P糖蛋白的作用模式.结果表明,异戊烯化修饰可显著提高类黄酮的亲脂性,修饰产物能更好地与P糖蛋白的疏水性口袋契合,二者结合程度高.
[Abstract]:The 3D quantitative structure-activity relationship (3D-QSAR) model of 30 flavonoid P-glycoprotein inhibitors (3D-QSAR) was established by using Topomer CoMFA based on R group search technique. The external predictive ability of the model was verified with a test set of 9 samples. The complex correlation coefficients of the model for fitting, cross validation and external validation are 0.971QK20.728 and 0.8160.28, respectively, and the correlation coefficients of the two models are 0. 728 and 0. 816, respectively. On the basis of this, the interaction pattern of Albus and its isopentenated derivatives with P glycoprotein was studied by Surflex-dock molecular docking method. The results showed that isopentenated modification could significantly improve the lipophilicity of flavonoids, and the modified product could better fit with the hydrophobic pocket of P glycoprotein, and the binding degree of the two products was high.
【作者单位】: 河南科技学院食品学院;重庆大学生物工程学院生物流变科学与技术教育部重点实验室;
【基金】:国家自然科学基金(批准号:31571782,21166024) 河南省高校科技创新团队(批准号:16IRTSTHN007) 河南省高校科技创新人才项目(批准号:14HASTIT019) 河南省基础与前沿技术研究计划项目(批准号:162300410177)资助~~
【分类号】:R96

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本文编号:2110370

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