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表达数量性状位点分析在药物基因组学中的应用

发布时间:2018-11-22 17:21
【摘要】:在全基因组关联分析(GWAS)时代发现的大量药物应答相关位点位于非编码序列,对其机制解释多关注于这些位点对mRNA表达水平的影响。表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTL)分析研究mRNA水平与基因组关联,其对遗传变异与基因表达关系、基因间相互作用和基因调控网络等的阐明为药物基因组学提供了有效研究手段。在药物基因组学中结合GWAS研究与eQTL研究,能够更好地阐明基因多态性对药物应答的影响,发现更多与药物疗效及毒性相关的生物标志物,为临床个体化用药的开展提供依据。
[Abstract]:During the whole genome association analysis (GWAS), a large number of drug response-related loci were found in non-coding sequences. The mechanism of these sites is mainly concerned with the effect of these loci on the expression of mRNA. Quantitative trait locus (expression quantitative trait loci,eQTL) analysis was used to study the relationship between mRNA level and genome, and the relationship between genetic variation and gene expression. The elucidation of gene interactions and gene regulatory networks provides an effective tool for pharmacogenomics. The combination of GWAS and eQTL studies in pharmacogenomics can better elucidate the effect of gene polymorphism on drug response, and find more biomarkers related to the efficacy and toxicity of drugs, and provide evidence for the development of individualized drugs.
【作者单位】: 中南大学湘雅医院临床药理研究所;中南大学临床药理研究所遗传药理学湖南省重点实验室;复旦大学遗传与发育协同创新中心;湖南省分子靶标新药研究协同创新中心;
【基金】:国家重点研发计划项目(2016YFC0905000,2016YFC0905001) 国家高技术研究发展计划(863计划)资助项目(2012AA02A518) 国家自然科学基金资助项目(81522048,81573511,81273595,81403017) 中南大学创新驱动计划项目(2016CX024);中南大学研究生创新项目(2016zzts518,2015zzts117),中南大学中央高校基本科研业务费专项资金资助
【分类号】:R96

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