MDCK细胞渗透性计算机预测模型的建立与评价

发布时间：2021-02-09 11:40

　　一、研究背景及目的本课题采用MOE2011,从期刊文献数据库,化学信息学数据库等收集MDCK细胞渗透性数据,计算并筛选分子描述符,进行MDCK细胞渗透性模型的建立并评价。本课题旨在建立一个稳健、可靠的MDCK细胞渗透性模型,为药物早期发现过程中筛选提供一个MDCK细胞渗透性数据评价的有力工具。二、方法与结果1.MDCK细胞渗透性性模型的建立本章通过网络进行MDCK细胞渗透性数据收集,并进行格式转换,并输入。采用MOE2011进行分子能量优化,分子描述符（包括2D分子描述符和3D分子描述符）的计算,并随机划分为训练集和测试集。去除重复,或相关性较大的描述符,或为常量的分子描述符,后采用GA-PLA进行分子描述符的筛选,最终获得10个分子描述符。采用MLR进行线性模型的建立。模型的均方根误差（RMSE）为0.43207,相关系数R2为0.86628。2.MDCK细胞渗透性模型的评价本章采用MDE2011AutoQS/AR模块,用LOO验证法,5折交叉验证法,Y随机化法,测试集验证法,模型应用域等进行MDCK细胞渗透性模型的评价。LOO RMSE为0.52019,LOO R2为0.80768... 

【文章来源】：中南大学湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：88 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

药物研发中主要失败原因的分析

药物口服生物利用的屏障

图1-4分子描述符连接化学结构和生物活性示意图

【参考文献】：
期刊论文
[1]QSAR模型内部和外部验证方法综述[J]. 覃礼堂,刘树深,肖乾芬,吴庆生.  环境化学. 2013(07)



本文编号：3025573