几种重要蛋白底物传递机制理论计算及相关药物设计

发布时间：2021-11-24 12:06

　　蛋白质作为一种重要的有机大分子,在生命活动中承担着重要作用。随着生命科学领域研究的不断深入,越来越多的蛋白基因序列被解析出来,以此为基础发展的以探究蛋白质组和功能基因组为主的生命科学进入了新的篇章。随着计算机计算能力的提升以及模拟方法理论逐渐完善,以物理、数学和化学等学科综合发展而来的分子动力学作为一种新型的理论指导工具,在蛋白-底物的相互作用、底物传递与释放等过程的机制研究中发挥着越来越重要的作用,它能够从动态角度探究蛋白质瞬时构象变化,对实验进行解释及预测。同时,在以构象契合理念为基础的药物设计中,动力学模拟可以在微观层面探究分子的生物作用机制,结合同源建模,分子对接等计算机辅助药物设计工具,可以验证药物分子的药效模型,并指导药物的改造设计。本论文主要采用分子动力学模拟的方法,结合伞形采样等多种技术,对热点蛋白的底物释放及作用机制进行研究,并结合3D-QSAR,对相关抑制剂进行设计,主要研究内容如下:1:组蛋白赖氨酸特异性去甲基化酶1（Lysine-specific demethylase 1,LSD1）是一种典型的组蛋白特异性去甲基化酶,对于探究组蛋白甲基化修饰有着重要意义。以苯... 

【文章来源】：河南大学河南省

【文章页数】：109 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

LSD1蛋白不同结构域部位cartoon示意图

简化前后的动力学模拟熵变模型示意图

图 3-3 3D-QSAR 分子叠合图及叠合骨架示意图 3-1 苯环丙胺类 LSD1 抑制剂 Training Set 结构，实验活性数据及 3D-QSAR 结The structures，actual and predicted pIC50values of the Training SetibitorstructBioactivity (pIC50)RRRRActual Predicted


本文编号：3515945