FtsZ小分子抑制剂的筛选及抗S.aureus活性评价
发布时间:2022-09-21 18:27
目的寻找靶向细丝温度敏感蛋白Z(FtsZ)新型结构的抗菌药物。方法采用Discovery Studio 2017软件通过多重策略虚拟筛选靶向结合FtsZ、具有潜在成药性的小分子化合物;通过肉汤稀释法评价小分子化合物对金黄色葡萄球菌(S.aureus)的抗菌作用;分子动力学模拟评价小分子化合物与FtsZ蛋白结合稳定性。结果虚拟筛选获得15个与FtsZ蛋白晶体结构有良好结合作用的小分子化合物;抗菌活性评价显示筛选出的化合物对甲氧西林敏感的金黄色葡萄球菌(MSSA)和耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)均有一定的抗菌作用,其中化合物5010-0572的活性最好,对两种菌最小抑菌浓度(MIC)值达都到1μg/ml;分子动力学模显示抗菌活性好的化合物5010-0572与FtsZ结合稳定性远远好于抗菌活性较差的化合物C592-0444。结论靶向FtsZ的小分子化合物抗菌活性与蛋白结合稳定性密切相关;化合物5010-0572具有良好的抗S.aureus活性,具有成为抗菌药物先导化合物的潜力。
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 主要设备与试剂
1.2 方法
1.2.1 靶标的准备
1.2.2 软件适用性评价
1.2.3 虚拟筛选
1.2.3.1 Libdock模块筛选
1.2.3.2 Ligandfit模块筛选
1.2.3.3 CDOCKER模块筛选
1.2.3.4 Flexible Docking模块筛选
1.2.3.5 类药性筛选
1.2.4 最小抑菌浓度(Minimum inhibitory concentration, MIC)检测
1.2.5 分子动力学模拟
2 结果
2.1 对接软件适用性评价
2.2 虚拟筛选结果
2.3 化合物抗菌活性评价
2.4 配体-受体复合物体系稳定性评价
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]计算机辅助药物设计的研究进展[J]. 刘轲,陈曦,蔡如意,应沂岑,郭雪媛,赵清璇,初明. 转化医学电子杂志. 2018(09)
[2]以FtsZ蛋白为靶点的抗菌天然产物的研究进展[J]. 马思提,魏国栋,刘慧,何方正. 药学研究. 2015(10)
本文编号:3680446
【文章页数】:6 页
【文章目录】:
1 材料与方法
1.1 主要设备与试剂
1.2 方法
1.2.1 靶标的准备
1.2.2 软件适用性评价
1.2.3 虚拟筛选
1.2.3.1 Libdock模块筛选
1.2.3.2 Ligandfit模块筛选
1.2.3.3 CDOCKER模块筛选
1.2.3.4 Flexible Docking模块筛选
1.2.3.5 类药性筛选
1.2.4 最小抑菌浓度(Minimum inhibitory concentration, MIC)检测
1.2.5 分子动力学模拟
2 结果
2.1 对接软件适用性评价
2.2 虚拟筛选结果
2.3 化合物抗菌活性评价
2.4 配体-受体复合物体系稳定性评价
3 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]计算机辅助药物设计的研究进展[J]. 刘轲,陈曦,蔡如意,应沂岑,郭雪媛,赵清璇,初明. 转化医学电子杂志. 2018(09)
[2]以FtsZ蛋白为靶点的抗菌天然产物的研究进展[J]. 马思提,魏国栋,刘慧,何方正. 药学研究. 2015(10)
本文编号:3680446
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