p53突变体Y220C小分子稳定剂的虚拟筛选

发布时间：2017-08-15 23:27

  本文关键词：p53突变体Y220C小分子稳定剂的虚拟筛选

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【摘要】：为了获得p53突变体的稳定剂,依次利用利宾斯基五原则,通过2次分子对接和全原子分子动力学(MD)模拟从Drug Bank 4.0数据库中筛选获得了潜在的稳定剂他克林.利用MD模拟进一步验证他克林和目标蛋白质之间的亲和作用.结果表明,他克林能够紧密结合到Y220C突变所形成的疏水空腔之中;他克林和目标蛋白质之间的主要作用力为疏水和静电相互作用,其中疏水相互作用占主导地位.此外,他克林分别与目标蛋白质的残基Leu145,Val147和Asp228形成3个氢键.基于MD模拟轨迹分析了他克林与p53CY220C的结合过程.由硫黄素T荧光光谱进一步证明他克林能够提高p53C-Y220C突变体的稳定性.
【作者单位】： 天津大学化工学院生物工程系系统生物工程教育部重点实验室;
【关键词】： 癌症 蛋白质稳定剂 分子对接 分子动力学模拟 p 他克林
【基金】：国家自然科学基金(批准号:21576199) 中国博士后科学基金(批准号:2013M530115;2012T50241)资助~~
【分类号】：TP311.13;R91
【正文快照】： p53是一种重要的肿瘤抑制蛋白质,具有阻滞肿瘤细胞生长、促进肿瘤细胞凋亡以及抑制肿瘤血管生成等多种生物学功能[1].p53含有5个结构域,分别为N末端反式激活结构域、脯氨酸富集域、核心DNA结合域、四聚体区域和C末端区域.p53共含有393个氨基酸,其中94~292位氨基酸为该蛋白质的

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本文编号：680420