浙江省宁波市2016年流行性腮腺炎病毒基因型特征分析

发布时间：2018-03-01 15:36

  本文关键词： 流行性腮腺炎病毒 基因型 进化树　出处：《中国疫苗和免疫》2017年04期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：目的了解宁波市2016年流行性腮腺炎病毒(Mumps virus,Mu V)基因型特征。方法采用Vero/SLAM细胞分离Mu V,对Mu V毒株小疏水蛋白(Small hydrophobic protein,SH)基因进行逆转录-聚合酶链反应扩增和序列测定,与Gen Bank中参考株序列进行比较。结果宁波市2016年共分离到5株Mu V,均为F基因型,核苷酸及氨基酸之间同源性分别为95.07%和94.74%;与F基因型参考株Z77161同源性分别为96.42%-97.09%和94.74%-96.49%;与中国疫苗株S79同源性分别为80.66%-81.52%和73.68%-75.44%;与中国其他地区F基因型之间同源性分别为95.05%-97.42%和91.23%-96.49%。结论 2016年宁波地区Mu V流行株均为F基因型,未发现SH基因变异。
[Abstract]:Objective to investigate the genotypic characteristics of mumps virus Mumps virus (Mumps virus) Mu V in Ningbo on 2016. Methods the small hydrophobic protein SHV gene of Mumps virus strain was isolated by Vero/SLAM cells and amplified by reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) and sequenced. Results in 2016, five strains of Mu V were isolated in Ningbo, all of which were F genotype. The homology between nucleotide and amino acid was 95.07% and 94.74, the homology with F genotype reference strain Z77161 was 96.42-97.09% and 94.74-96.49m, with Chinese vaccine strain S79 was 80.66-81.52% and 73.68-75.44g, respectively. Conclusion in 2016, the epidemic strains of Mu V in Ningbo were all F genotypes. No SH gene mutation was found.
【作者单位】： 宁波市疾病预防控制中心;
【基金】：浙江省医学重点学科(编号:07-013) 宁波市自然科学基金(编号:2016A610020)
【分类号】：R181.3;R512.1

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