社区高脂饮食人群的肠道菌群分析和干预研究
发布时间：2022-01-08 15:41
目的:改革开放以来,随着人们生活水平的不断提高,中国人群的饮食方式逐步转变为以高脂饮食为主的日常膳食,随之出现肥胖、2型糖尿病、心脑血管疾病、炎性肠病、结直肠癌等饮食相关性疾病的发病率及死亡率逐年提高。越来越多的研究发现肠道菌群结构及功能的改变在上述疾病中的发生发展中发挥重要作用,并在某些疾病中已发现特征性核心菌群改变。本研究正是基于我国社区人口学、饮食及健康特征,探索社区高脂饮食健康人群在发生严重疾病之前的肠道菌群特征性改变,并试图通过添加益生菌及膳食干预的方法改善肠道菌群结构,达到一级预防的目的。方法:（1）膳食模式、人口学、健康状况的调查问卷及分组。在江阴市周庄镇两社区共招募健康成年人214人,采用食物频率法调查过去1年每人每天进食的食物种类、量及频次,根据《2017年中国食品成分表（第一册第二版）》将所有食物折算成每日摄入脂肪、碳水化合物、蛋白质及纤维素的量,再以40%的脂肪供能比例为分组标准,大于等于40%的为高脂饮食组（HFD组）,小于40%的为低脂饮食组（LFD组）,再通过调查问卷的方式,调查人口学、健康状况等其他九方面并进行比较。（2）粪便及结肠粘膜组织的采集。进行调查...
【文章来源】：南京医科大学江苏省
【文章页数】：136 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２〗６Ｓ?ｒＤＮＡ测序流程??１．２．５．３基因组ＤＮＡ提取和鉴定??
并保存于－８０°Ｃ冰箱。抽提得到ＤＮＡ基因组完整性用１％琼脂糖凝胶电泳检验。??１．２．５．４?ＤＮＡ?扩增??采用细菌１６ＳｒＤＮＡＶ３－Ｖ４区作为靶标进行ＰＣＲ扩增（图３）。扩增引物如??下：３１９Ｆ５’－ＡＣＴＣＣＴＡＣＧＧＧＡＧＧＣＡＧＣＡＧ－３＇；?８０６Ｒ５＇－ＧＧＡＣＴＡＣＨＶＧＧＧＴＷ??ＴＣＴＡＡＴ－３’。扩增体系如表２所示。反应程序为：９８°Ｃ预变性３０秒；９８°Ｃ变性??１０秒，５４°Ｃ退火３０秒，７２°Ｃ延伸４５秒，执行３５个循环；最后７２°Ｃ延伸１０分??钟结束；１６°Ｃ放置１０分钟。一轮扩增反应之后，在正反向引物两端分别加上不??同的Ｂａｒｃｏｄｅｓ以区别不同的样本，再进行下一轮扩增。扩增完成的ＰＣＲ产物??用ｂｅａｄｓ纯化。用超纯水代替样本行ＰＣＲ扩增排除假阳性作为阴性对照。??２０??
１．２．６．１分析流程??本研究测序分析针对Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｍｉｓｅｑ?２＞＜３００ｂｐ?ｐａｉｒｅｄ－ｅｎｄ测序数据进行分析??（图４?）。对于Ｍｉｓｅｑ测序获得的双端数据，首先根据ｂａｒｃｏｄｅ信息进行样本区分，??然后根据ｏｖｅｒｌａｐ关系进行ｍｅｒｇｅ拼接成ｔａｇ，接着对拼接完成的数据进行数据过??滤，然后进行Ｑ２０、Ｑ３０等质控分析。对最终获得ｃｌｅａｎ数据进行可操作分类单??元（ｏｐｅｒａｔｉｏｎａｌ?ｔａｘｏｎｏｍｉｃ?ｕｎｉｔ，ＯＴＵ）聚类分析和物种分类学分析。在物种分??类学上，利用公司独特注释工具对序列进一步精细到分类学上“种”的划分。??２２??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Effect of dietary interventions on the intestinal microbiota of Mongolian hosts[J]. Jing Li,Haiyan Xu,Zhihong Sun,Qiangchuan Hou,Lai-Yu Kwok,Wuri Laga,Yanjie Wang,Huimin Ma,Zhongjie Yu,Bilige Menghe,Heping Zhang. Science Bulletin. 2016(20)
[2]Effects of different diets on intestinal microbiota and nonalcoholic fatty liver disease development[J]. Jian-Ping Liu,Wen-Li Zou,Shui-Jiao Chen,Hong-Yun Wei,Ya-Ni Yin,Yi-You Zou,Fang-Gen Lu. World Journal of Gastroenterology. 2016(32)
[3]Faecalibacterium prausnitzii supernatant ameliorates dextran sulfate sodium induced colitis by regulating Th17 cell differentiation[J]. Xiao-Li Huang,Xin Zhang,Xian-Yan Fei,Zhao-Gui Chen,Yan-Ping Hao,Shu Zhang,Ming-Ming Zhang,Yan-Qiu Yu,Cheng-Gong Yu. World Journal of Gastroenterology. 2016(22)
[4]emerging role of the β-catenin-PPARγ axis in the pathogenesis of colorectal cancer[J]. Lina Sabatino,Massimo Pancione,Carolina Votino,Tommaso Colangelo,Angelo Lupo,Ettore Novellino,Antonio Lavecchia,Vittorio Colantuoni. World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
[5]Colon cancer-associated B2 Escherichia coli colonize gut mucosa and promote cell proliferation[J]. Jennifer Raisch,Emmanuel Buc,Mathilde Bonnet,Pierre Sauvanet,Emilie Vazeille,Amélie de Vallée,Pierre Déchelotte,Claude Darcha,Denis Pezet,Richard Bonnet,Marie-Agnès Bringer,Arlette Darfeuille-Michaud. World Journal of Gastroenterology. 2014(21)
本文编号：3576825
【文章来源】：南京医科大学江苏省
【文章页数】：136 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图２〗６Ｓ?ｒＤＮＡ测序流程??１．２．５．３基因组ＤＮＡ提取和鉴定??
并保存于－８０°Ｃ冰箱。抽提得到ＤＮＡ基因组完整性用１％琼脂糖凝胶电泳检验。??１．２．５．４?ＤＮＡ?扩增??采用细菌１６ＳｒＤＮＡＶ３－Ｖ４区作为靶标进行ＰＣＲ扩增（图３）。扩增引物如??下：３１９Ｆ５’－ＡＣＴＣＣＴＡＣＧＧＧＡＧＧＣＡＧＣＡＧ－３＇；?８０６Ｒ５＇－ＧＧＡＣＴＡＣＨＶＧＧＧＴＷ??ＴＣＴＡＡＴ－３’。扩增体系如表２所示。反应程序为：９８°Ｃ预变性３０秒；９８°Ｃ变性??１０秒，５４°Ｃ退火３０秒，７２°Ｃ延伸４５秒，执行３５个循环；最后７２°Ｃ延伸１０分??钟结束；１６°Ｃ放置１０分钟。一轮扩增反应之后，在正反向引物两端分别加上不??同的Ｂａｒｃｏｄｅｓ以区别不同的样本，再进行下一轮扩增。扩增完成的ＰＣＲ产物??用ｂｅａｄｓ纯化。用超纯水代替样本行ＰＣＲ扩增排除假阳性作为阴性对照。??２０??
１．２．６．１分析流程??本研究测序分析针对Ｉｌｌｕｍｉｎａ?Ｍｉｓｅｑ?２＞＜３００ｂｐ?ｐａｉｒｅｄ－ｅｎｄ测序数据进行分析??（图４?）。对于Ｍｉｓｅｑ测序获得的双端数据，首先根据ｂａｒｃｏｄｅ信息进行样本区分，??然后根据ｏｖｅｒｌａｐ关系进行ｍｅｒｇｅ拼接成ｔａｇ，接着对拼接完成的数据进行数据过??滤，然后进行Ｑ２０、Ｑ３０等质控分析。对最终获得ｃｌｅａｎ数据进行可操作分类单??元（ｏｐｅｒａｔｉｏｎａｌ?ｔａｘｏｎｏｍｉｃ?ｕｎｉｔ，ＯＴＵ）聚类分析和物种分类学分析。在物种分??类学上，利用公司独特注释工具对序列进一步精细到分类学上“种”的划分。??２２??
【参考文献】：
期刊论文
[1]Effect of dietary interventions on the intestinal microbiota of Mongolian hosts[J]. Jing Li,Haiyan Xu,Zhihong Sun,Qiangchuan Hou,Lai-Yu Kwok,Wuri Laga,Yanjie Wang,Huimin Ma,Zhongjie Yu,Bilige Menghe,Heping Zhang. Science Bulletin. 2016(20)
[2]Effects of different diets on intestinal microbiota and nonalcoholic fatty liver disease development[J]. Jian-Ping Liu,Wen-Li Zou,Shui-Jiao Chen,Hong-Yun Wei,Ya-Ni Yin,Yi-You Zou,Fang-Gen Lu. World Journal of Gastroenterology. 2016(32)
[3]Faecalibacterium prausnitzii supernatant ameliorates dextran sulfate sodium induced colitis by regulating Th17 cell differentiation[J]. Xiao-Li Huang,Xin Zhang,Xian-Yan Fei,Zhao-Gui Chen,Yan-Ping Hao,Shu Zhang,Ming-Ming Zhang,Yan-Qiu Yu,Cheng-Gong Yu. World Journal of Gastroenterology. 2016(22)
[4]emerging role of the β-catenin-PPARγ axis in the pathogenesis of colorectal cancer[J]. Lina Sabatino,Massimo Pancione,Carolina Votino,Tommaso Colangelo,Angelo Lupo,Ettore Novellino,Antonio Lavecchia,Vittorio Colantuoni. World Journal of Gastroenterology. 2014(23)
[5]Colon cancer-associated B2 Escherichia coli colonize gut mucosa and promote cell proliferation[J]. Jennifer Raisch,Emmanuel Buc,Mathilde Bonnet,Pierre Sauvanet,Emilie Vazeille,Amélie de Vallée,Pierre Déchelotte,Claude Darcha,Denis Pezet,Richard Bonnet,Marie-Agnès Bringer,Arlette Darfeuille-Michaud. World Journal of Gastroenterology. 2014(21)
本文编号：3576825
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