二噁英暴露跨代遗传对mRNA/lncRNA影响的研究
发布时间:2023-11-05 12:24
目的:2,3,7,8-四氯代二苯并-对-二噁英(TCDD)可引起表型的跨代遗传效应。本研究通过基因芯片对性腺性别决定期宫内暴露TCDD的F1-F3代雄性大鼠肝脏mRNA和lncRNA表达谱进行研究,并进行生物信息学分析,探索mRNA和lncRNA在F1-F3代代际内和代际间的改变以及发挥的潜在作用机制。方法:建立大鼠跨代遗传模型,在F0代雌性SD大鼠孕8-14天(GD 8-14)连续每天给予灌胃染毒,剂量分别为0和200 ng/kg bw TCDD。取F1-F3代成年雄性大鼠肝脏,每组3例,共计18个样本,使用Arraystar Rat LncRNA芯片进行mRNA和lncRNA的检测,确定mRNA和lncRNA的差异表达谱;运用qRT-PCR方法检测F1代Slc34a2、Zfp37和Agxt2,F2代Bcl6、Aft3和Adh4,F3代Ccnd1、Cyp7a1、Fcgbp、Hsd17b2、Aldh1a7、Lrtm2和Trib3 mRNA表达水平以及F1代XR347266、XR593760、XR343608和XR
【文章页数】:158 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
缩略语/符号说明
前言
研究现状、成果
研究目的、方法
一、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 mRNA表达谱变化以及生物信息学分析
1.1 对象和方法
1.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的的建立
1.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异mRNA
1.1.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达m RNA的验证
1.1.4 统计学分析
1.2 结果
1.2.1 RNA质量控制检测结果
1.2.2 芯片检测结果
1.2.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达m RNA的验证
1.3 讨论
1.3.1 出生前TCDD暴露对F1 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.3.2 出生前TCDD暴露对F2 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.3.3 出生前TCDD暴露对F3 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.4 小结
二、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 lnc RNA表达谱变化以及生物信息学分析
2.1 对象和方法
2.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的建立
2.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异lnc RNA
2.1.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达lnc RNA的验证
2.1.4 统计学分析
2.2 结果
2.2.1 芯片检测结果
2.2.2 lncRNA子类分析
2.2.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达lnc RNA的验证
2.3 讨论
2.4 小结
三、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 mRNA和lncR NA 代际间趋势分析
3.1 对象和方法
3.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的建立
3.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异lnc RNA
3.1.3 统计学分析
3.2 结果
3.2.1 F1-F3 代际间TCDD染毒组m RNA和 lnc RNA的差异表达
3.2.2 F1-F3 代际间TCDD染毒组m RNAs差异基因表达的功能和通路分析
3.2.3 lncRNA子类分析
3.2.4 F1-F3代TCDD染毒组m RNA和 lncRNA模型谱趋势分析
3.3 讨论
3.4 小结
全文结论
论文创新点
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
综述
综述参考文献
致谢
个人简历
本文编号:3861026
【文章页数】:158 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
中文摘要
Abstract
缩略语/符号说明
前言
研究现状、成果
研究目的、方法
一、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 mRNA表达谱变化以及生物信息学分析
1.1 对象和方法
1.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的的建立
1.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异mRNA
1.1.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达m RNA的验证
1.1.4 统计学分析
1.2 结果
1.2.1 RNA质量控制检测结果
1.2.2 芯片检测结果
1.2.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达m RNA的验证
1.3 讨论
1.3.1 出生前TCDD暴露对F1 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.3.2 出生前TCDD暴露对F2 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.3.3 出生前TCDD暴露对F3 代雄性大鼠肝脏m RNA表达的影响
1.4 小结
二、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 lnc RNA表达谱变化以及生物信息学分析
2.1 对象和方法
2.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的建立
2.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异lnc RNA
2.1.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达lnc RNA的验证
2.1.4 统计学分析
2.2 结果
2.2.1 芯片检测结果
2.2.2 lncRNA子类分析
2.2.3 实时荧光定量PCR对芯片部分差异表达lnc RNA的验证
2.3 讨论
2.4 小结
三、出生前 TCDD 暴露跨代遗传大鼠模型肝脏中 mRNA和lncR NA 代际间趋势分析
3.1 对象和方法
3.1.1 出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型的建立
3.1.2 基因芯片筛选出生前TCDD暴露所致跨代遗传大鼠模型肝脏中的差异lnc RNA
3.1.3 统计学分析
3.2 结果
3.2.1 F1-F3 代际间TCDD染毒组m RNA和 lnc RNA的差异表达
3.2.2 F1-F3 代际间TCDD染毒组m RNAs差异基因表达的功能和通路分析
3.2.3 lncRNA子类分析
3.2.4 F1-F3代TCDD染毒组m RNA和 lncRNA模型谱趋势分析
3.3 讨论
3.4 小结
全文结论
论文创新点
参考文献
发表论文和参加科研情况说明
附录
综述
综述参考文献
致谢
个人简历
本文编号:3861026
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