重庆市库蚊标本中宜昌病毒的分离鉴定

发布时间：2024-07-09 00:37

　　目的对2017年采集自重庆地区蚊虫标本携带的病毒进行分离鉴定。方法采用组织细胞培养法进行病毒分离,应用高通量测序技术获得病毒分离物的全基因组序列,采用系统发育法进行种类及分子特征分析。结果库蚊标本来源的病毒阳性分离物CQFD2017能引起白纹伊蚊细胞C6/36病变,但不能引起金黄地鼠肾细胞BHK-21、非洲绿猴肾细胞Vero病变。CQFD2017全基因组序列长度为20 893 bp,包含6个开放阅读框。系统进化分析发现,该毒株位于Nidovirales病毒目Mesoniviridae病毒科的Yichang病毒所在的进化分支,与Yichang病毒(NC₀40534)的核苷酸一致性为98.6%,ORF1a和ORF1b区氨基酸一致性分别为99.06%和99.15%,因此将该毒株命名为Yichang病毒CQFD2017株。结论 2017年重庆市库蚊标本分离的CQFD2017株为Yichang病毒。

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【部分图文】：

图1蚊虫标本采集地点

2017年9月,在重庆市巴南区和丰都县共采集到732只蚊虫标本(图1),其中骚扰阿蚊672只(92%),致倦库蚊30只(4%),三带喙库蚊30只(4%)。这些蚊虫被分为20批次接种细胞。从重庆地区丰都县致倦库蚊标本分离物在接种C6/36细胞后72h开始引起细胞CPE。CPE的主....

图2CQFD2017对C6/36细胞致病变作用

为了研究CQFD2017的系统进化地位,从NCBI的GenBank下载了与CQFD2017相似性≥30%的RNA依赖的RNA聚合酶(RNA-dependentRNApolymerase,RdRp)氨基酸序列,并用于构建系统发育树。分析表明,CQFD2017属于Mesoni....

图3基于宜昌病毒分离株CQFD2017的RdRp区氨基酸序列的系统进化分析

表1CQFD2017与Mesoniviridae病毒科家族成员的氨基酸序列比对分析Tab.1AminoacididentitiesbetweenCQFD2017andothermembersoffamilyMesoniviridaeVirusCQFD2....

本文编号：4004121