陕西关中野生商陆资源的ITS2和psbA-trnH条形码序列研究

发布时间：2020-10-18 14:22

　　 为探讨DNA条形码在陕西关中野生商陆资源中的鉴定作用,本研究采用通用引物ITS2和psbA-trnH对29份商陆样品DNA进行PCR扩增和测序,用Codon CodeA-ligner V3.0进行序列拼接和校对,随后进行BLAST比对鉴定分析;同时运用MEGA 6.0分析序列特征、K2P遗传距离及种内或种间变异,并构建系统进化树,评价两对引物对该区域商陆及其混伪品的鉴别能力。研究结果表明, ITS2和psbA-trnH序列的PCR扩增和测序成功率均为100%; NJ系统进化树显示ITS2和psbA-trnH序列均可明显将所有样本分别聚为商陆、垂序商陆并与其同属近源种鄂西商陆、日本商陆及两种混伪品各自聚为不同分支; ITS2序列在种间遗传距离上较psbA-trnH有一定优势。ITS2和psbA-trnH序列均可作为DNA条形码对商陆及其混伪品进行识别和鉴定,为商陆资源品种现状与分布研究及合理开发利用提供理论依据。
【文章目录】：
材料与方法
结果与分析
    1 DNA扩增及测序
    2 NCBI数据库和中药材DNA条形码鉴定系统比对分析
    3序列特征及遗传距离分析
    4系统进化树构建分析
讨论

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本文编号：2846411