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基于网络药理学探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎潜在作用机制

发布时间:2020-11-05 04:41
   目的:运用网络药理学技术筛选葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的主要活性成分,预测活性成分的作用靶点,建立单味药-活性成分-作用靶点网络,进一步探讨葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的潜在效应机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集葛根芩连汤中4味中药的化学成分,借助人类基因数据库(GeneCards)获取UC的相关靶点基因,将药物作用靶点和疾病相关靶标基因取交集得到该方治疗UC的关键作用靶点,使用String数据库对关键作用靶点构建蛋白质相互作用网络,并通过Cytoscape软件将结果可视化。借助DAVID和ClueGo对关键作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集。结果:共收集葛根芩连汤138个活性成分和27个关键作用靶点。其中,STAT3、TNF、CXCL8、IL1B、VEGFA、TP53、IL10、AKT1等关键基因主要通过调控NF-κB、IL-17、Toll样受体、MAPK、PI3K-Akt、Jak/STAT、TNF等信号通路,在细胞外泌体、质膜外侧、细胞核中发挥作用。结论:葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎是多靶点、多个信号通路共同调节的复杂过程,预测葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的潜在机制,为深入研究葛根芩连汤治疗溃疡性结肠炎的作用机制提供理论依据与参考。
【部分图文】:

网络图,靶点,活性成分,网络图


通过GeneCards平台收集UC相关靶点基因,搜索到关于UC相关靶点3 870个。按score分数排序,收集数值大于15的靶点,共96个。将疾病靶点与活性成分作用靶点取交集后最终获得27个关键靶点基因(见图2)。关键靶点具体为:AKT1,BAX,CCND1,CDKN1A,CRP,CXCL8,EGF,ERBB2,ICAM1,IFNG,白细胞介素(interleukin,IL)-10,IL-1B,IL-2,IL-4,MMP1,MMP9,MPO,NOS2,PPARG,PTGS1,PTGS2,STAT1,STAT3,TGFB1,TNF,TP53,VEGFA。图2 疾病靶点基因与药物活性成分靶点基因的匹配

网络图,靶点,活性成分,基因


疾病靶点基因与药物活性成分靶点基因的匹配

靶点,相互作用,基因


对关键靶点基因进行GO富集分析,根据FDR筛选得到22个条目(见图5)。靶点关联的生物过程主要有在对宿主中共生体生长的负调控、调控生长因子及细胞因子活性RNA聚合酶Ⅱ启动子对转录的正调节作用、同种型转换为IgG同种型的正调节、MHC II类生物合成过程的正调节、趋化因子生物合成过程的正调节、蛋白质磷酸化及寡聚化的正调节、细胞周期停滞、过氧化物酶活性的调节、炎症反应、外源性凋亡信号传导途径、基因表达的负调控、对细菌的防御反应、细胞色素c从线粒体释放的正调节、胰岛素分泌的调节等。图4 葛根芩连汤-UC蛋白相互作用网络
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本文编号:2871145

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