基于网络药理学和分子生物学探讨温下方治疗肺癌的作用机制

发布时间：2020-11-19 18:15

　　 【目的】应用网络药理学方法预测温下方(由人参、大黄、附子、当归组成)治疗肺癌疾病的作用靶点和信号通路,并通过细胞实验验证其预测的准确性。【方法】搜索TCMSP数据库获得温下方组成药物的有效活性成分,使用Cytoscape软件建立活性成分-作用靶点网络,使用String数据库和Cytoscape软件绘制蛋白相互作用网络,并通过DAVID数据库对靶点进行基因本体论(GO)注释及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。制备不同浓度温下方含药血清作用A549细胞,采用四甲基偶氮唑盐(MTT)方法测定细胞增殖情况,采用定量聚合酶链反应(qPCR)技术测定苏氨酸激酶(AKT)的mRNA表达水平,验证预测结果的可靠性。【结果】温下方作用于肺癌的有效活性成分有32个,相关靶点112个,在靶点间的蛋白-蛋白相互作用网络中,分析出温下方中有39个重要靶点与治疗肺癌有关。验证实验可知,温下方含药血清能浓度依赖性抑制A549细胞的增殖,下调AKT mRNA水平。【结论】温下方治疗肺癌具有多成分-多靶点-多途径的作用特点,可为深入研究其机制指明方向。
【部分图文】：

从TTD数据库里收集到有关肺癌的疾病靶点一共有77个：TPBG、MMP2、MMP9、ALK、PDGFRA、BCL2、BIRC5、FGFR1、PDGFRB、BRAF、CEACAM5、CDK1、CDK7、CDK9、CDK4、COX17、DRD2、TOP1、MAP2K1、HSP90B1、EGFL7、EGFR、FANCF、HPSE、HGF、HDAC1、IGF1R、ITGB1、IL2、IL4R、MMP1、KIF11、KDM1A、CSF1、MMP12、MARK3、MMP7、MAGEA3、MAGEC1、MAGEC2、MAD1L1、BAD、CLU、EIF4E、HSPB1、PRKCA、OPRM1、NTSR1、NFE2L2、CTAG1A、P2RY2、PDCD1、PPARG、PECAM1、FNTB、FNTA、ABL1、RET、AKT1、ERBB2、ERBB3、CHEK1、PLK1、ALB、SSTR2、SKP2、S1PR1、TYMS、TLR9、TUBB3、PRAME、TNFRSF10A、TNFRSF10B、TUSC2、MDM2、FLT1、KDR。图2 温下方成分-靶点网络

温下方成分-靶点网络

通过Cytoscape软件，获得成分靶点-疾病靶点的蛋白质相互作用关系网络。见图3。图3共涉及170个节点，1 145条边。圆圈大小和颜色深浅代表靶点蛋白相互作用的密切程度，橘红色圆圈节点代表符合筛选条件的39个重要靶点。边代表靶点间的相互关联，节点大小代表Degree值的大小，节点越大，对应的Degree值越大。1.2.4 39个重要靶点的GO注释与KEGG通路分析
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本文编号：2890307