参麦饮改善糖尿病肾病的网络药理学研究及实验验证
发布时间:2020-12-01 15:20
目的:利用网络药理学技术结合动物实验验证,探讨参麦饮改善糖尿病肾病(Diabetic Nephropathy,DN)可能的作用靶点与作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台数据库(TCMSP)、中医百科全书平台(ETCM)收集参麦饮中红参、麦冬的化学成分。通过整合药物靶标数据库(TTD)、Drugbank数据库、疾病基因与突变位点数据库(DisGeNET)筛选出DN相关的靶标建立靶点信息。运用蛋白质相互作用网络数据库(STRING)平台构建靶蛋白互作网络(PPI),将PPI网络导入Cytoscape软件进行网络拓扑结构分析,筛选出关键靶点,利用功能注释生物信息学分析平台(DAVID)数据库对关键靶点进行基因本体论(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用Cytoscape 3.2.1软件构建化合物-靶点-通路网络。造模糖尿病肾病大鼠模型,参麦饮干预6 w后检测大鼠的血糖(FBG)、24 h微量白蛋白(mAlb)、血尿素氮(BUN)、血肌酐(Scr)。肾组织使用蛋白免疫印迹法(Western blot)验证预测信号通路。结果:利用网络合并及网络拓扑结构分析...
【文章来源】:中药药理与临床. 2020年04期 第81-87页 北大核心
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
参麦饮与糖尿病肾病的韦恩图
GO富集分析了关键靶点的功能分布,根据P值升序选取前15个GO分析条目,GO生物过程(Biological process)主要涉及的生物过程包括正向调控蛋白质磷酸化、一氧化氮生物合成、RNA聚合酶II启动子的转录、负调控细胞凋亡过程、调节JAK-STAT级联参与生长激素信号通路、调节磷脂酰肌醇3-激酶信号等;Cellular component(细胞组分)与核质、胞核、细胞间黏连相关性最大;Molecular fuction(分子功能)与蛋白结合、酶结合相关性最大,见图2。2.3.2 参麦饮活性成分治疗DN KEGG通路分析
利用Cytoscape 3.2.1软件构建候选化合物-靶点网络、通路-靶点网络,利用软件中 merge功能,进行网络合并得到“化合物-靶点-通路”网络图,如图(4)。该网络包括80个节点,251条边,参与该网络的红参活性成分19个,麦冬活性成分28个,作用的靶点13个,富集的通路30个。计算参麦饮活性化合物的度值,以度值为标准,筛选出节点度值大于等于中位数2的化合物,其中红参16个,麦冬23个,见表2。这些候选化合物可能在参麦饮改善糖尿病肾病起着重要作用。红参与麦冬之间存在1个化合物与多个靶点之间的相互作用,同时也可能存在不同化合物共同作用于同1个靶点的现象,这充分体现了中药多成分与多靶点之间共同作用的机制。图4 参麦饮的“活性成分-靶点-通路”网络图
【参考文献】:
期刊论文--------
[1]中医治疗气阴两虚型2型糖尿病研究进展[J]. 杨玉娟,金智生. 中医研究. 2020(08)
[2]糖尿病肾脏病大鼠造模方法的改进及肾组织IL-10表达水平[J]. 曹东东,黎妞,曹子彧,侯玉龙,倪文娟,冷小敏,刘云,师晶晶,郭明好,马东红. 临床肾脏病杂志. 2020(05)
[3]小檗碱通过PI3K/Akt通路调控水通道蛋白-1表达改善糖尿病大鼠肾功能[J]. 孙明东,田鹤,于洋,阎文柱. 解剖学杂志. 2019(06)
[4]基于网络药理学挖掘玉米须干预糖尿病的机制研究[J]. 高莹,张晶璇,黄羚. 天津中医药. 2019(07)
[5]高脂联合小剂量链脲佐菌素建立实验性2型糖尿病大鼠模型[J]. 吴瑛,张勇,姚合斌. 转化医学杂志. 2017(06)
[6]2型糖尿病患者中医证型分布及其并发症证型特点[J]. 史雅琼,马建伟. 河南中医. 2017(10)
[7]参麦方对于大鼠心肌损伤保护作用的代谢组学研究[J]. 李杰,胡超,许龙龙,马增春,梁乾德,汤响林,王宇光,谭洪玲,肖成荣,高月. 中国药理学通报. 2016(11)
[8]肾消通络方对糖尿病肾病大鼠肾功能及肾组织病理形态结构的影响[J]. 马国平,丁英钧,董绍英,刘洪斌,赵玉庸. 中国老年学杂志. 2016(08)
[9]MIF、TLR4、TNF-α水平在糖尿病肾病患者中的变化及其临床意义[J]. 危正南,李涛,张庆红,陈新河,吴东,杨红荣. 疑难病杂志. 2016(02)
[10]红参的炮制、化学成分及药理活性研究进展[J]. 周秋秋,任谓明,王艳红,杨丹,王国明,李月茹. 上海中医药杂志. 2016(02)
[1]Update on Diabetic Nephropathy: Core Curriculum 2018[J] . Kausik Umanath,Julia B. Lewis. American Journal of Kidney Diseases . 2018 (6)
[2]Inhibition of the VEGF/VEGFR Pathway Improves Survival in Advanced Kidney Cancer: A Systematic Review and Meta-Analysis[J] . Roberto Iacovelli,Cora N. Sternberg,Camillo Porta,Elena Verzoni,Filippo de Braud,Bernard Escudier,Giuseppe Procopio. Current Drug Targets . 2015 (2)
[3]The PI3K/p-Akt signaling pathway participates in calcitriol ameliorating podocyte injury in DN rats[J] . Zhixia Song,Yinfeng Guo,Min Zhou,Xiaoliang Zhang. Metabolism . 2014 (10)
本文编号:2894914
【文章来源】:中药药理与临床. 2020年04期 第81-87页 北大核心
【文章页数】:7 页
【部分图文】:
参麦饮与糖尿病肾病的韦恩图
GO富集分析了关键靶点的功能分布,根据P值升序选取前15个GO分析条目,GO生物过程(Biological process)主要涉及的生物过程包括正向调控蛋白质磷酸化、一氧化氮生物合成、RNA聚合酶II启动子的转录、负调控细胞凋亡过程、调节JAK-STAT级联参与生长激素信号通路、调节磷脂酰肌醇3-激酶信号等;Cellular component(细胞组分)与核质、胞核、细胞间黏连相关性最大;Molecular fuction(分子功能)与蛋白结合、酶结合相关性最大,见图2。2.3.2 参麦饮活性成分治疗DN KEGG通路分析
利用Cytoscape 3.2.1软件构建候选化合物-靶点网络、通路-靶点网络,利用软件中 merge功能,进行网络合并得到“化合物-靶点-通路”网络图,如图(4)。该网络包括80个节点,251条边,参与该网络的红参活性成分19个,麦冬活性成分28个,作用的靶点13个,富集的通路30个。计算参麦饮活性化合物的度值,以度值为标准,筛选出节点度值大于等于中位数2的化合物,其中红参16个,麦冬23个,见表2。这些候选化合物可能在参麦饮改善糖尿病肾病起着重要作用。红参与麦冬之间存在1个化合物与多个靶点之间的相互作用,同时也可能存在不同化合物共同作用于同1个靶点的现象,这充分体现了中药多成分与多靶点之间共同作用的机制。图4 参麦饮的“活性成分-靶点-通路”网络图
【参考文献】:
期刊论文--------
[1]中医治疗气阴两虚型2型糖尿病研究进展[J]. 杨玉娟,金智生. 中医研究. 2020(08)
[2]糖尿病肾脏病大鼠造模方法的改进及肾组织IL-10表达水平[J]. 曹东东,黎妞,曹子彧,侯玉龙,倪文娟,冷小敏,刘云,师晶晶,郭明好,马东红. 临床肾脏病杂志. 2020(05)
[3]小檗碱通过PI3K/Akt通路调控水通道蛋白-1表达改善糖尿病大鼠肾功能[J]. 孙明东,田鹤,于洋,阎文柱. 解剖学杂志. 2019(06)
[4]基于网络药理学挖掘玉米须干预糖尿病的机制研究[J]. 高莹,张晶璇,黄羚. 天津中医药. 2019(07)
[5]高脂联合小剂量链脲佐菌素建立实验性2型糖尿病大鼠模型[J]. 吴瑛,张勇,姚合斌. 转化医学杂志. 2017(06)
[6]2型糖尿病患者中医证型分布及其并发症证型特点[J]. 史雅琼,马建伟. 河南中医. 2017(10)
[7]参麦方对于大鼠心肌损伤保护作用的代谢组学研究[J]. 李杰,胡超,许龙龙,马增春,梁乾德,汤响林,王宇光,谭洪玲,肖成荣,高月. 中国药理学通报. 2016(11)
[8]肾消通络方对糖尿病肾病大鼠肾功能及肾组织病理形态结构的影响[J]. 马国平,丁英钧,董绍英,刘洪斌,赵玉庸. 中国老年学杂志. 2016(08)
[9]MIF、TLR4、TNF-α水平在糖尿病肾病患者中的变化及其临床意义[J]. 危正南,李涛,张庆红,陈新河,吴东,杨红荣. 疑难病杂志. 2016(02)
[10]红参的炮制、化学成分及药理活性研究进展[J]. 周秋秋,任谓明,王艳红,杨丹,王国明,李月茹. 上海中医药杂志. 2016(02)
[1]Update on Diabetic Nephropathy: Core Curriculum 2018[J] . Kausik Umanath,Julia B. Lewis. American Journal of Kidney Diseases . 2018 (6)
[2]Inhibition of the VEGF/VEGFR Pathway Improves Survival in Advanced Kidney Cancer: A Systematic Review and Meta-Analysis[J] . Roberto Iacovelli,Cora N. Sternberg,Camillo Porta,Elena Verzoni,Filippo de Braud,Bernard Escudier,Giuseppe Procopio. Current Drug Targets . 2015 (2)
[3]The PI3K/p-Akt signaling pathway participates in calcitriol ameliorating podocyte injury in DN rats[J] . Zhixia Song,Yinfeng Guo,Min Zhou,Xiaoliang Zhang. Metabolism . 2014 (10)
本文编号:2894914
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zhongyaolw/2894914.html