基于RNA-seq技术分析复方通络饮治疗脑梗死的转录组学特征

发布时间：2020-12-28 14:26

　　目的:通过转录组测序（RNA-seq, RNA-seqence）技术探讨复方通络饮治疗脑梗死的可能机制。方法:雄性SD大鼠,造永久性大脑中动脉梗死（pMCAO, permanent middle cerebral occlusion）模型后,分为模型对照组和复方通络饮24 g/kg治疗组,另设正常对照组。各组灌胃生理盐水或等体积药物,每日1次。术后7 d末次给药后2 h断头处死,取缺血侧脑组织进行RNA-Seq转录组测序。结果:通过RNA-Seq测序发现与正常对照组比较,模型对照组差异表达基因功能主要集中在绑定分子功能（binding）、催化活性（catalytic activity）功能等方面;与模型对照组比较,复方通络饮24 g/kg治疗组差异表达基因集中在白细胞跨内皮迁移（leukocyte transendothelial migration）与黏着斑通路（focal adhesion）。对部分差异基因进行了蛋白表达水平的验证,发现与模型对照组比较,复方通络饮24 g/kg治疗组能够明显下调缺血侧脑组织ICAM-1（细胞间黏附分子-1）、MMP-9 （基质金属蛋白酶-9）蛋白表... 

【文章来源】：中药药理与临床. 2020年03期 北大核心

【文章页数】：6 页

【部分图文】：

脑梗死大鼠模型对照组与正常对照组比较差异基因表达火山图

脑梗死大鼠模型对照组与正常对照组比较差异基因GO功能分析

表2 复方通络饮24 g/kg组治疗脑梗死大鼠与模型对照组比较显著差异表达基因 基因 倍数(与模型对照组比较) 显著上调基因 Gcc2 2.35 Dzip3 2.24 Gabrb2 3.22 Ccdc88a 2.26 Zfp386 2.43 Smc6 2.32 Rb1cc1 2.62 Zfp101 3.68 Kcnh7 3.38 Ccdc41 2.54 Phip 2.38 Kcnh5 4.52 Samd9l 2.62 Ttc14 2.58 Zfp638 2.41 Zfp458 5.03 Ermn 2.26 Herc6 2.73 Vps13a 2.56 Zfp292 2.27 Rock1 2.31 Slfn3 2.86 显著下调基因 ICAM-1 -4.41 Igfbp3 -2.67 MMP-9 -4.97 Ctgf -2.72 Hif3a -2.72 显著差异表达基因定义为 FDR≤0.01且倍数差异在2倍以上的基因。图4 复方通络饮治疗组与脑梗死大鼠模型对照组比较显著差异基因聚类热图

【参考文献】：
期刊论文
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[5]复方通络胶囊预处理大脑中动脉缺血再灌注大鼠后血浆vWFTM含量和MMP-2 mRNA表达的变化[J]. 王敬卿,肖婧,张绒.  辽宁中医药大学学报. 2011(04)
[6]复方通络胶囊对大脑中动脉缺血再灌注大鼠的预防性保护作用[J]. 王敬卿,肖婧,张绒.  江苏中医药. 2010(01)
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本文编号：2943913