基于网络药理学探讨斑蝥素抗小细胞肺癌的分子机制研究
发布时间:2021-01-27 06:13
目的:基于网络药理学探讨斑蝥素抗小细胞肺癌的关键靶点。方法:斑蝥素靶点通过Swiss Target Prediction进行筛选,采用Genecards和CTD数据库筛选小细胞肺癌靶点,通过FunRich软件获得共有靶点,用GeneMANIA进行基因富集分析,对关键靶点进行相互作用分析(STRING),采用分子对接对关键靶点进行验证分析。结果:获得24个靶点,富集分析发现:共表达(co-expression)占35.49%、物理相关性(Physical Interactions)占34.86%、预测(Predicted)占20.20%,EGFR、PTGS2和TLR4为关键靶点;通过分子对接发现:斑蝥素与PTGS2有较好的结合。结论:初步明确斑蝥素可能通过调节EGFR、PTGS2和TLR4抗小细胞肺癌,其中主要靶点为PTGS2。
【文章来源】:中医药信息. 2020,37(05)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
化学成分-疾病靶点
24个靶点基于GeneMANIA分析靶蛋白的相互作用,其中共定位(co-localization)占0.98%、共表达(co-expression)占35.49%、物理相关性(Physical Interactions)占34.86%、预测(Predicted)占20.20%、蛋白结构域(Shated protein domains)占4.65%、遗传相关性(Genetic Interactions)占1.86%,见图2。2.3 关键靶点分析
基于STRING结合Cytoscape通过degree筛选,选择degree大于12的为关键靶点,EGFR、PTGS2和TLR4为关键靶点,见图3。2.4 iGEMDOCK分子对接结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]全球肝癌流行概况[J]. 魏矿荣,彭侠彪,梁智恒,岑惠珊. 中国肿瘤. 2015(08)
[2]基于分子对接技术的常用降糖中药有效成分虚拟筛选[J]. 林桂源,姚华聪,郑细娜,李晓金,陈超乐,赵肃清,郑杰. 中国实验方剂学杂志. 2015(15)
[3]斑蝥素及其衍生物抗肿瘤研究近况[J]. 周杰,吴敬波. 西南军医. 2014(03)
[4]中药斑蝥研究进展[J]. 刘亚楠. 中药与临床. 2013(04)
[5]斑蝥素及其衍生物的作用机制和临床应用[J]. 赵良中,李妍. 黑龙江畜牧兽医. 2010(21)
[6]中药斑蝥的现代研究进展[J]. 赵丽娜,张振凌. 中国民族民间医药. 2010(09)
[7]斑蝥素及其衍生物抗肿瘤作用机制的研究进展[J]. 施秀青,徐瑞荣. 浙江中西医结合杂志. 2007(12)
[8]斑蝥素抑制人宫颈癌Hela细胞增殖的研究[J]. 王晓华,马萍,尹元琴,张卫东,姜又红. 中国医科大学学报. 2007(02)
[9]斑蝥素诱导人胰腺癌细胞凋亡的实验研究[J]. 周季兰,姚玮艳,章永平,乔敏敏,袁耀宗. 胰腺病学. 2006(06)
[10]斑蝥合剂对H22肝癌小鼠的抑瘤及免疫调节作用[J]. 周阿高,张勇,孔德云,王颖,张惠珍,王树军,蒉纲,洪声,葛海良,任秋华,毛旭明,董佳容. 中西医结合学报. 2006(05)
本文编号:3002580
【文章来源】:中医药信息. 2020,37(05)
【文章页数】:4 页
【部分图文】:
化学成分-疾病靶点
24个靶点基于GeneMANIA分析靶蛋白的相互作用,其中共定位(co-localization)占0.98%、共表达(co-expression)占35.49%、物理相关性(Physical Interactions)占34.86%、预测(Predicted)占20.20%、蛋白结构域(Shated protein domains)占4.65%、遗传相关性(Genetic Interactions)占1.86%,见图2。2.3 关键靶点分析
基于STRING结合Cytoscape通过degree筛选,选择degree大于12的为关键靶点,EGFR、PTGS2和TLR4为关键靶点,见图3。2.4 iGEMDOCK分子对接结果
【参考文献】:
期刊论文
[1]全球肝癌流行概况[J]. 魏矿荣,彭侠彪,梁智恒,岑惠珊. 中国肿瘤. 2015(08)
[2]基于分子对接技术的常用降糖中药有效成分虚拟筛选[J]. 林桂源,姚华聪,郑细娜,李晓金,陈超乐,赵肃清,郑杰. 中国实验方剂学杂志. 2015(15)
[3]斑蝥素及其衍生物抗肿瘤研究近况[J]. 周杰,吴敬波. 西南军医. 2014(03)
[4]中药斑蝥研究进展[J]. 刘亚楠. 中药与临床. 2013(04)
[5]斑蝥素及其衍生物的作用机制和临床应用[J]. 赵良中,李妍. 黑龙江畜牧兽医. 2010(21)
[6]中药斑蝥的现代研究进展[J]. 赵丽娜,张振凌. 中国民族民间医药. 2010(09)
[7]斑蝥素及其衍生物抗肿瘤作用机制的研究进展[J]. 施秀青,徐瑞荣. 浙江中西医结合杂志. 2007(12)
[8]斑蝥素抑制人宫颈癌Hela细胞增殖的研究[J]. 王晓华,马萍,尹元琴,张卫东,姜又红. 中国医科大学学报. 2007(02)
[9]斑蝥素诱导人胰腺癌细胞凋亡的实验研究[J]. 周季兰,姚玮艳,章永平,乔敏敏,袁耀宗. 胰腺病学. 2006(06)
[10]斑蝥合剂对H22肝癌小鼠的抑瘤及免疫调节作用[J]. 周阿高,张勇,孔德云,王颖,张惠珍,王树军,蒉纲,洪声,葛海良,任秋华,毛旭明,董佳容. 中西医结合学报. 2006(05)
本文编号:3002580
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