基于网络药理学的葛根素治疗动脉粥样硬化潜在分子机制研究

发布时间：2021-02-11 04:06

　　目的通过网络药理学方法探讨葛根素（puerarin）治疗动脉粥样硬化（AS）潜在的分子生物学机制。方法从PubChem数据库找出葛根素SDF、Mol2、Canonical SMILES号,从中药系统药理学分析平台（TCMSP）、 SwissTargetPrediction、SEA、STITCH数据库查找所有葛根素潜在的作用靶点,并构建成分-靶点网络;通过Therapeutic Target Database、DrugBank以及DisGeNET数据库查找与AS相关的靶点,并将葛根素与AS靶点进行映射;利用STRING平台对映射的靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用网络的构建,并筛选核心靶点;对核心靶点进行网络分析,同时利用DAVID数据库对核心靶点蛋白进行GO生物学功能（MF）、生物学过程（BP）、细胞学组分（CC）及KEGG通路富集分析,结果进行数据可视化处理,并构建葛根素-靶点-信号通路多维网络。结果以"puerarin"的不同表现格式（SDF、Mol2、Canonical SMILES号）为筛选条件,整合上述分子靶点数据,共得到103个潜在靶点;以"atherosclerosis"为检... 

【文章来源】：中华中医药学刊. 2020,38(09)北大核心

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

葛根素分子结构图

将“puerarin”与103个潜在靶点经过数据编排上传至Cytoscape 3.7.1软件,得到葛根素-靶点网络图,其中绿色代表葛根素,灰蓝色代表葛根素作用的靶点。见图2。2.3 疾病靶点的筛选

将上述葛根素及AS靶点依次上传至蛋白标准化数据库Uniprot进行靶点基因标准化,再通过Venny2.1绘制韦恩图,见图3。其中黄色代表AS靶点,灰蓝色代表葛根素靶点,将21个共有靶点基因上传至STRING平台,得到PPI网络图,见插页Ⅳ图4。2.5 GO生物过程和KEGG通路富集分析


本文编号：3028494