基于GC-MS与网络药理学的青皮挥发油防治阿尔茨海默症的活性成分及作用机制研究
发布时间:2021-04-01 03:27
目的:预测青皮挥发油防治阿尔茨海默病(AD)的主要活性成分和潜在作用靶点。方法:采用气质联用技术(GC-MS)分析青皮挥发油化学成分,并借助NIST 11.L数据库和人工数据解析进行成分的结构鉴定。借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)、PharmMapper数据库等预测青皮挥发油活性成分及其对应靶点,借助GeneCards数据库、人类孟德尔遗传数据库等挖掘AD相关靶点;利用Venny 2.1.0软件映射以获取青皮挥发油防治AD的直接靶点;借助STRING数据库和Cytoscape 7.2.1软件挖掘核心节点,利用Venny 2.1.0软件映射并去重后获取青皮挥发油防治AD的间接靶点;借助DAVID 6.7数据库对上述直接和间接靶点(即作用靶点)进行基因本体(GO)功能富集和KEGG通路富集分析;采用Cytoscape 7.2.1软件,以节点度值、介数中心度、紧密中心度为指标,对青皮挥发油"活性成分-作用靶点"网络进行拓扑学分析,挖掘关键成分和关键靶点。结果与结论:GC-MS法共分离并鉴定出青皮挥发油化学成分40个,均为活性成分,包括右旋柠檬烯、γ-萜品烯等。共挖掘出活性成分对应靶点...
【文章来源】:中国药房. 2020,31(17)北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
青皮挥发油GC-MS总离子流图
GO功能富集结果显示,89个作用靶点主要涉及GO功能过程564个(P<0.05)。其中,生物过程富集440个,以有机物的反应(Response to organic substance)、对内生刺激的反应(Response to endogenous stimulus)、细胞内信号级联(Intracellular signaling cascade)等为主;细胞组分富集43个,以细胞分数(Cell fraction)、轴突(Axon)、胞浆(Cytosol)、不溶性组分(Insoluble fraction)等为主;分子功能富集81个,以胺受体活性(Amine receptor activity)、蛋白激酶活性(Protein kinase activity)、胺结合(Amine binding)、肾上腺素受体活性(Adrenoceptor activity)等为主,详见图3。图3 青皮挥发油防治AD作用靶点的GO功能富集柱状图
图2 青皮挥发油防治AD作用靶点KEGG通路富集结果显示,89个作用靶点主要富集于19条通路上(P<0.05),以癌症通路(Pathways in cancer)、局灶性粘连(Focal adhesion)、结直肠癌(Colorectal cancer)、钙信号通路(Calcium signaling pathway)、神经营养素信号通路(Neurotrophin signaling pathway)等为主,详见图4。
本文编号:3112607
【文章来源】:中国药房. 2020,31(17)北大核心
【文章页数】:8 页
【部分图文】:
青皮挥发油GC-MS总离子流图
GO功能富集结果显示,89个作用靶点主要涉及GO功能过程564个(P<0.05)。其中,生物过程富集440个,以有机物的反应(Response to organic substance)、对内生刺激的反应(Response to endogenous stimulus)、细胞内信号级联(Intracellular signaling cascade)等为主;细胞组分富集43个,以细胞分数(Cell fraction)、轴突(Axon)、胞浆(Cytosol)、不溶性组分(Insoluble fraction)等为主;分子功能富集81个,以胺受体活性(Amine receptor activity)、蛋白激酶活性(Protein kinase activity)、胺结合(Amine binding)、肾上腺素受体活性(Adrenoceptor activity)等为主,详见图3。图3 青皮挥发油防治AD作用靶点的GO功能富集柱状图
图2 青皮挥发油防治AD作用靶点KEGG通路富集结果显示,89个作用靶点主要富集于19条通路上(P<0.05),以癌症通路(Pathways in cancer)、局灶性粘连(Focal adhesion)、结直肠癌(Colorectal cancer)、钙信号通路(Calcium signaling pathway)、神经营养素信号通路(Neurotrophin signaling pathway)等为主,详见图4。
本文编号:3112607
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