基于网络药理学的半边莲-半枝莲药对抗胃癌相关作用机制研究

发布时间：2021-05-13 17:27

　　目的:基于网络药理学方法探讨半边莲-半枝莲药对抗胃癌的相关作用机制。方法:利用TCMSP数据库获得半边莲和半枝莲的化学成分及对应作用靶点基因,检索Gene Cards和OMIM数据库获得疾病胃癌相关靶点基因,然后取两者的交集,得到半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因。利用Cytoscape 3.7.1软件构建半边莲-半枝莲药对化合物-作用靶点-疾病三者相互关系网络,采用STRING数据库对半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因进行蛋白互作网络分析,利用Cytoscape 3.7.1软件的插件Cytohubba筛选出关键基因（hub基因）,并利用ONCOMINE数据库分析关键基因在胃癌中的表达情况。利用在线工具DAVID进行GO功能富集分析和利用Cytoscape 3.7.1软件的Clue GO插件进行KEGG信号通路富集分析。结果:共筛选出半边莲-半枝莲药对作用于胃癌的预测靶基因81个,关键靶基因（hub基因）6个,这些关键基因在ONCOMINE数据库的胃癌样本和正常样本中存在显著的表达差异。GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、凋亡过程的负调控等生物过程;K... 

【文章来源】：药物分析杂志. 2020,40(07)北大核心CSCD

【文章页数】：11 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 数据库及软件
    1.2 半边莲-半枝莲药对的化学成分及作用靶点筛选
    1.3 疾病胃癌靶点筛选
    1.4 网络的构建及分析
    1.5 基因本体（gene ontology,GO）功能富集分析
    1.6 京都基因和基因组百科全书（kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）通路富集分析
2 结果
    2.1 半边莲-半枝莲药对化学成分及作用靶点筛选
    2.2 胃癌靶点筛选
    2.3 网络的构建及分析
    2.4靶点蛋白相互作用网络（PPI网络）构建及关键基因（hub基因）筛选
    2.5 基因本体（GO）功能富集分析
    2.6 KEGG通路富集分析
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
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硕士论文
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本文编号：3184424