六神丸干预新型冠状肺炎的靶点挖掘及分子对接研究
发布时间：2021-06-23 12:23
目的运用网络药理学数据挖掘方法,探讨六神丸干预新型冠状病毒肺炎（COVID-19）药效的潜在分子机制。方法利用BATMAN、Drugbank和GeneCards等数据库及相关文献筛选六神丸活性成分和潜在活性靶点以及疾病相关作用靶点。通过STRING、Metascape构建靶点的蛋白互作网络和功能注释。采用SYBYL-X2.1.1进行分子对接分析。结果共筛选出47个有效成分和877个对应靶点,在进一步与435个疾病靶点交集后得出73个COVID-19相关基因（如EGFR、IL6、MAPK1、MAPK3、TNF等）。GO和KEGG通路分析表明这些基因功能与癌症相关通路、百日咳通路、细胞因子活性、MAPK路径以及疱疹病毒感染路径相关。从与ACE2和3CL水解酶的分子对接分析中得出六神丸多组分能直接作用于病毒入侵和复制。结论六神丸干预COVID-19与其抗病毒、抑制炎症反应、抑制体液渗出、改善血液循环等路径密切相关。
【文章来源】：南京中医药大学学报. 2020,36(05)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
六神丸干预COVID-19成分-靶点图
六神丸干预COVID-19相关靶点的功能注释
GO通路分析(图3B～D):分子功能(MF)涉及592条通路,主要富集条目为磷酸酶结合(Phosphatase binding);磷酸转移酶活性,醇基受体(Phosphotransferase activity, Alcohol group as acceptor);磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸-5-激酶活性(Phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate5-kinase activity);病毒受体活性(Virus receptor activity);细胞因子受体结合(Cytokine receptor binding)等。在生物过程(BP)涉及3 689条通路,主要富集条目为类二十烷酸代谢过程(Icosanoid metabolic process);激素水平的调节(Regulation of hormone levels);白细胞迁移(Leukocyte migration);细胞因子介导的信号通路(Cytokine-mediated signaling pathway);调节细胞粘附(Regulation of cell adhesion)等。在细胞组成(CC)涉及350条通路,主要富集条目在膜筏(Membrane raft)、膜面(Side membrane)和磷脂酰肌醇3-激酶复合物(Phosphatidylinositol3-kinase complex)中。这些路径可能是六神丸活性成分干预COVID-19的抗病毒和抗炎的药理学基础。图3 六神丸干预COVID-19相关靶点的功能注释
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于新冠肺炎病理生理机制的治疗策略[J]. 高钰琪. 中国病理生理杂志. 2020(03)
[2]从“寒湿疫”角度探讨新型冠状病毒肺炎的中医药防治策略[J]. 仝小林,李修洋,赵林华,李青伟,杨映映,林轶群,丁齐又,雷烨,王强,宋斌,刘文科,沈仕伟,朱向东,黄飞剑,周毅德. 中医杂志. 2020(06)
[3]1-磷酸鞘氨醇与相关疾病的研究进展[J]. 张婧瑶,刘卫东,刘函晔,李良昌,延光海,刘恒辰,崔弘. 生理科学进展. 2019(03)
[4]五味消毒饮治疗肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂相关皮疹30例临床观察[J]. 陈学武,姜靖雯,林海峰. 中医杂志. 2016(10)
[5]右美托咪定对内毒素诱导的急性肺损伤大鼠p38丝裂原激活的蛋白激酶的活化及炎症反应的影响[J]. 杨颖,王鹏,封光,刘功俭. 国际麻醉学与复苏杂志. 2014 (03)
[6]六神丸抗炎镇痛活性的主药分析研究[J]. 马宏跃,寇俊萍,余伯阳. 江苏中医药. 2010(02)
博士论文
[1]小肠缺血再灌注后TNF-α诱导的Caspase-8与NF-κB在肺损伤中的作用[D]. 陈玉强.吉林大学 2011
本文编号：3244933
【文章来源】：南京中医药大学学报. 2020,36(05)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【部分图文】：
六神丸干预COVID-19成分-靶点图
六神丸干预COVID-19相关靶点的功能注释
GO通路分析(图3B～D):分子功能(MF)涉及592条通路,主要富集条目为磷酸酶结合(Phosphatase binding);磷酸转移酶活性,醇基受体(Phosphotransferase activity, Alcohol group as acceptor);磷脂酰肌醇-3,4-二磷酸-5-激酶活性(Phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate5-kinase activity);病毒受体活性(Virus receptor activity);细胞因子受体结合(Cytokine receptor binding)等。在生物过程(BP)涉及3 689条通路,主要富集条目为类二十烷酸代谢过程(Icosanoid metabolic process);激素水平的调节(Regulation of hormone levels);白细胞迁移(Leukocyte migration);细胞因子介导的信号通路(Cytokine-mediated signaling pathway);调节细胞粘附(Regulation of cell adhesion)等。在细胞组成(CC)涉及350条通路,主要富集条目在膜筏(Membrane raft)、膜面(Side membrane)和磷脂酰肌醇3-激酶复合物(Phosphatidylinositol3-kinase complex)中。这些路径可能是六神丸活性成分干预COVID-19的抗病毒和抗炎的药理学基础。图3 六神丸干预COVID-19相关靶点的功能注释
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于新冠肺炎病理生理机制的治疗策略[J]. 高钰琪. 中国病理生理杂志. 2020(03)
[2]从“寒湿疫”角度探讨新型冠状病毒肺炎的中医药防治策略[J]. 仝小林,李修洋,赵林华,李青伟,杨映映,林轶群,丁齐又,雷烨,王强,宋斌,刘文科,沈仕伟,朱向东,黄飞剑,周毅德. 中医杂志. 2020(06)
[3]1-磷酸鞘氨醇与相关疾病的研究进展[J]. 张婧瑶,刘卫东,刘函晔,李良昌,延光海,刘恒辰,崔弘. 生理科学进展. 2019(03)
[4]五味消毒饮治疗肺癌患者表皮生长因子受体酪氨酸激酶抑制剂相关皮疹30例临床观察[J]. 陈学武,姜靖雯,林海峰. 中医杂志. 2016(10)
[5]右美托咪定对内毒素诱导的急性肺损伤大鼠p38丝裂原激活的蛋白激酶的活化及炎症反应的影响[J]. 杨颖,王鹏,封光,刘功俭. 国际麻醉学与复苏杂志. 2014 (03)
[6]六神丸抗炎镇痛活性的主药分析研究[J]. 马宏跃,寇俊萍,余伯阳. 江苏中医药. 2010(02)
博士论文
[1]小肠缺血再灌注后TNF-α诱导的Caspase-8与NF-κB在肺损伤中的作用[D]. 陈玉强.吉林大学 2011
本文编号：3244933
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