基于网络药理学研究西红花抗炎作用的分子机制
发布时间：2021-08-20 03:41
目的:通过网络药理学的手段研究西红花抗炎作用的分子机制。方法:搜集并整理得到西红花的有效成分信息,上传至Swiss数据库,匹配得到西红花有效成分对应的靶点蛋白,利用Cytoscape3.4.1软件构建有效成分-靶点的网络,对得到的靶点进行GO富集分析。通过TTD、CTD和OMIM数据库得到抗炎作用相关的靶点信息,建立疾病-靶点网络。选择Cytoscape 3.4.1中Merge功能对两个网络进行结合,得到有效成分-靶点-疾病网络。利用DAVID数据库对预测得到的靶点信息进行GO生物功能学富集分析和KEGG pathway富集分析。结果:筛选得到西红花抗炎活性成分14个,主要为类胡萝卜素类、黄酮类和酚酸类化合物。与抗炎作用相关的靶点有13个,其中度值较高的靶点有EGFR、KDR、PTPRC、APP、MET、MAPK12。推测西红花中活性成分通过EGFR、KDR、PTPRC、APP、MET、MAPK12等靶点参与了生物体内细胞信号传导、细胞代谢和基因表达等过程,抑制了炎症因子的产生和释放,从而发挥了抗炎作用。
【文章来源】：中国野生植物资源. 2020,39(06)CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
基于网络药理学研究西红花抗炎作用流程图
将化学成分-靶点网络和抗炎-靶点网络合并得到西红花化学成分-靶点-疾病网络,见图4。其中西红花抗炎活性成分14个,主要有西红花酸、异鼠李素、山奈酚、咖啡酸、苦藏红花苷酸、藏花醛等;与西红花发挥抗炎作用的靶点有13个,分别是EGFR、KDR、PTPRC、MAPK12、APP、MET、FGFR1、LPAR1、SELE、CD38、MIF、ERBB2、DRD2、FLT4。其中,西红花酸、异鼠李素、山奈酚主要作用于EGFR和MAPK12; 咖啡酸、苦藏红花苷酸、藏花醛、3,5-二甲基苯甲醛主要作用于KDR、MET和FGFR1。从图4可以看出,西红花酸、异鼠李素、咖啡酸是西红花发挥抗炎作用的主要活性成分,EGFR、KDR、MAPK12、PTGRC、ERBB2为西红花发挥抗炎活性的主要靶点。图3b 抗炎靶点相互作用网络(PPI)
将TTD、CTD和OMIM数据库中筛选得到的抗炎靶点导入Cytoscape3.4.1,得到抗炎-靶点网络,结果见图3a。利用String11.0在线数据库构建得到这些靶点的蛋白质互相作用关系(PPI)网络,结果见图3b。图3a中共有63个与抗炎作用相关的靶点信息,图3b为这63个靶点之间的相互作用,其中degree值较大的靶点有肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶12(MAPK12)和人血管内皮生长因子受体2(KDR)。表2 有效成分对应的靶点信息Table 2 Target information of active components 靶点 通用名称 Uniprot名称 度值 Epidermal growth factor receptor EGFR P11511 11 Vascular endothelial growth factor receptor 2 KDR P00918 10 Hepatocyte growth factor receptor MET P08581 8 Mitogen-activated protein kinase 12 MAPK12 P53778 8 Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 TRPA1 O75762 8 Fibroblast growth factor receptor 1 FGFR1 P11362 6 Amine oxidase A MAO A P21397 6 Amine oxidase B MAO B Q14994 6 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 ERBB2 P04626 6 Vascular endothelial growth factor receptor 3 FLT4 P35916 6 Cyclic ADP-ribose hydrolase 1 CD38 P28907 5 E-selectin SELE P16581 5 Macrophage migration inhibitory factor MIF Q14174 5 Prostaglandin G/H synthase 2 COX-2 P35354 5 Fatty acid synthase FASN P49327 5 Alcohol dehydrogenase 1A ADH1A P07327 4 Carbonic anhydrase 1 CA1 P00915 4 Muscarinic acetylcholine receptor M1 CHRM1 P11229 4 Muscarinic acetylcholine receptor M2 CHRM2 P08172 4
【参考文献】：
期刊论文
[1]国内外不同来源藏红花的品质评价[J]. 林东昊,茅人飞. 食品研究与开发. 2019(13)
[2]网络药理学与中医药现代研究的若干进展[J]. 张彦琼,李梢. 中国药理学与毒理学杂志. 2015(06)
[3]西红花的化学成分和药理活性研究进展[J]. 王平,童应鹏,陶露霞,邵云东,刘晓平. 中草药. 2014(20)
本文编号：3352738
【文章来源】：中国野生植物资源. 2020,39(06)CSCD
【文章页数】：6 页
【部分图文】：
基于网络药理学研究西红花抗炎作用流程图
将化学成分-靶点网络和抗炎-靶点网络合并得到西红花化学成分-靶点-疾病网络,见图4。其中西红花抗炎活性成分14个,主要有西红花酸、异鼠李素、山奈酚、咖啡酸、苦藏红花苷酸、藏花醛等;与西红花发挥抗炎作用的靶点有13个,分别是EGFR、KDR、PTPRC、MAPK12、APP、MET、FGFR1、LPAR1、SELE、CD38、MIF、ERBB2、DRD2、FLT4。其中,西红花酸、异鼠李素、山奈酚主要作用于EGFR和MAPK12; 咖啡酸、苦藏红花苷酸、藏花醛、3,5-二甲基苯甲醛主要作用于KDR、MET和FGFR1。从图4可以看出,西红花酸、异鼠李素、咖啡酸是西红花发挥抗炎作用的主要活性成分,EGFR、KDR、MAPK12、PTGRC、ERBB2为西红花发挥抗炎活性的主要靶点。图3b 抗炎靶点相互作用网络(PPI)
将TTD、CTD和OMIM数据库中筛选得到的抗炎靶点导入Cytoscape3.4.1,得到抗炎-靶点网络,结果见图3a。利用String11.0在线数据库构建得到这些靶点的蛋白质互相作用关系(PPI)网络,结果见图3b。图3a中共有63个与抗炎作用相关的靶点信息,图3b为这63个靶点之间的相互作用,其中degree值较大的靶点有肿瘤坏死因子(TNF)、丝裂原活化蛋白激酶12(MAPK12)和人血管内皮生长因子受体2(KDR)。表2 有效成分对应的靶点信息Table 2 Target information of active components 靶点 通用名称 Uniprot名称 度值 Epidermal growth factor receptor EGFR P11511 11 Vascular endothelial growth factor receptor 2 KDR P00918 10 Hepatocyte growth factor receptor MET P08581 8 Mitogen-activated protein kinase 12 MAPK12 P53778 8 Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1 TRPA1 O75762 8 Fibroblast growth factor receptor 1 FGFR1 P11362 6 Amine oxidase A MAO A P21397 6 Amine oxidase B MAO B Q14994 6 Receptor tyrosine-protein kinase erbB-2 ERBB2 P04626 6 Vascular endothelial growth factor receptor 3 FLT4 P35916 6 Cyclic ADP-ribose hydrolase 1 CD38 P28907 5 E-selectin SELE P16581 5 Macrophage migration inhibitory factor MIF Q14174 5 Prostaglandin G/H synthase 2 COX-2 P35354 5 Fatty acid synthase FASN P49327 5 Alcohol dehydrogenase 1A ADH1A P07327 4 Carbonic anhydrase 1 CA1 P00915 4 Muscarinic acetylcholine receptor M1 CHRM1 P11229 4 Muscarinic acetylcholine receptor M2 CHRM2 P08172 4
【参考文献】：
期刊论文
[1]国内外不同来源藏红花的品质评价[J]. 林东昊,茅人飞. 食品研究与开发. 2019(13)
[2]网络药理学与中医药现代研究的若干进展[J]. 张彦琼,李梢. 中国药理学与毒理学杂志. 2015(06)
[3]西红花的化学成分和药理活性研究进展[J]. 王平,童应鹏,陶露霞,邵云东,刘晓平. 中草药. 2014(20)
本文编号：3352738
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