基于网络药理学对金银花抗癌机制的研究
发布时间：2021-10-07 08:49
目的:研究金银花治疗癌症的有效成分及作用机制。方法:通过数据库检索金银花的有效成分、作用靶蛋白等信息,构建"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络,进行京都基因与基因组百科全书（KEGG）信号通路、基因本体（GO）富集分析,研究金银花活性成分的抗癌机制。结果:构建一种药物,23种有效活性成分,248个相应靶蛋白的"药物-化学成分-靶蛋白-疾病"网络。有效成分包括槲皮素、木犀草素、金圣草素和山柰酚等;作用靶蛋白包括肿瘤转移相关的基质金属蛋白酶（MMP2、MMP1）、肿瘤坏死因子（TNF）等;KEGG通路富集分析包括磷脂酰肌醇激酶3（PI3K）等97条通路。结论:金银花抗癌是多成分、多靶标、多途径的作用机制。
【文章来源】：长治医学院学报. 2020,34(03)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
金银花药物靶蛋白KEGG富集分析
通过对金银花相应靶基因进行分子功能注释分析:(1)GO-MF得到82条基因的分子功能注释信息,主要涉及G蛋白偶联受体活性、蛋白质二聚体活性酶结合活性、分子传感性活性、 雄性激素受体活性等;(2)GO-BP得到787条基因的细胞组分注释分析,涉及膜功能区域、跨膜区、质膜区、突触等;(3)GO-CC得到77条生物学过程注释信息,涉及药物反应、细胞对化学刺激反应、生物量调节、细胞对内源性刺激反应等(见图2)。2.4 KEGG信号通路分析
在网络中,从节点(化合物)指向靶蛋白(作用基因),一个节点度值表示网络中和节点相连路线的条数。根据网络特性计算维度(Degree)、中心度值(Betweenness Centrality)等参数,这些连接化合物或靶蛋白较多的节点被认为是枢纽节点,可能是关键的化合物或者靶蛋白。通过分析化合物-靶蛋白之间的中心度值、亲中心度值等发现248个相应靶蛋白的“药物-化学成分-靶蛋白-疾病”网络,排名靠前的作用靶蛋白有PTGS2、PTGS1、NCOA2、PRKACA、GSTP1、HSP90AB1、JUN等。排名前7位的化合物分别是 MOL000449-Stigmasterol(豆甾醇)、MOL000098-Quercetin(槲皮素)、MOL000358-Stigmasterol beta(β-豆甾醇)、 MOL000006-Luteolin(木犀草素)、MOL000422-Kaempferol(山柰酚)、MOL003044-Chryseriol(金圣草素)、MOL001494-Mandenol(十八碳-9,12-二烯酸乙酯)(见图1)。2.3 GO富集分析
本文编号：3421728
【文章来源】：长治医学院学报. 2020,34(03)
【文章页数】：4 页
【部分图文】：
金银花药物靶蛋白KEGG富集分析
通过对金银花相应靶基因进行分子功能注释分析:(1)GO-MF得到82条基因的分子功能注释信息,主要涉及G蛋白偶联受体活性、蛋白质二聚体活性酶结合活性、分子传感性活性、 雄性激素受体活性等;(2)GO-BP得到787条基因的细胞组分注释分析,涉及膜功能区域、跨膜区、质膜区、突触等;(3)GO-CC得到77条生物学过程注释信息,涉及药物反应、细胞对化学刺激反应、生物量调节、细胞对内源性刺激反应等(见图2)。2.4 KEGG信号通路分析
在网络中,从节点(化合物)指向靶蛋白(作用基因),一个节点度值表示网络中和节点相连路线的条数。根据网络特性计算维度(Degree)、中心度值(Betweenness Centrality)等参数,这些连接化合物或靶蛋白较多的节点被认为是枢纽节点,可能是关键的化合物或者靶蛋白。通过分析化合物-靶蛋白之间的中心度值、亲中心度值等发现248个相应靶蛋白的“药物-化学成分-靶蛋白-疾病”网络,排名靠前的作用靶蛋白有PTGS2、PTGS1、NCOA2、PRKACA、GSTP1、HSP90AB1、JUN等。排名前7位的化合物分别是 MOL000449-Stigmasterol(豆甾醇)、MOL000098-Quercetin(槲皮素)、MOL000358-Stigmasterol beta(β-豆甾醇)、 MOL000006-Luteolin(木犀草素)、MOL000422-Kaempferol(山柰酚)、MOL003044-Chryseriol(金圣草素)、MOL001494-Mandenol(十八碳-9,12-二烯酸乙酯)(见图1)。2.3 GO富集分析
本文编号：3421728
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